[发明专利]一种与中国肥臀型绵羊“无尾”表型相关的分子标记及其应用

说明书

本发明公开一种用于检测绵羊尾型性状相关的单核苷酸的多态性标记SNPs及其应用。本发明用于检测中国绵羊尾型性状相关的单核苷酸的多态性标记SNPs，其特征在于所述SNPs标记位于绵羊8号染色体定位于87804590/87804589的两个位点，该SNPs分子标记两个位点完全连锁，多态性为G‑G和C‑T，基因型为G‑G/G‑G；G‑G/C‑T；C‑T/C‑T三种，其中C‑T/C‑T基因型只在中国肥臀型绵羊中检出，统计检验得出C‑T/C‑T基因型与绵羊“无尾”表型显著相关。本发明可用于中国地方绵羊品种尾型性状的早期选育，甚至胚胎期或者刚出生即可进行准确地筛选，该方法用于鉴定纯种的中国肥臀型地方绵羊品种准确可靠，操作简便的优点。

技术领域

本发明属于遗传生物学领域，涉及绵羊尾型相关的分子标记，具体与中国脂臀型绵羊无尾表型的T基因的单核苷酸的多态性（SNPs）分子标记及应用。

背景技术

为了适应不同的环境，绵羊经长期的自然选择产生了个体表型差异较大的品种，尾型的差异就是进化过程中主要的变化之一。现代家养绵羊由摩弗伦羊及羱羊进化而来，但他们的尾型都为短瘦尾，经过几千年的驯化尾型有长、短、肥、瘦的差异，依据尾巴长短和尾部脂肪体积大小可以将绵羊分为五大类型：短脂尾型如小尾寒羊、湖羊等；长脂尾型如广灵大尾羊、兰州大尾羊等；短瘦尾型如西藏羊、贵德黑裘皮羊等；长瘦尾型如甘肃高山细毛羊、新疆细毛羊等；肥臀尾型如哈萨克羊、阿勒泰羊等。绵羊的尾长由尾椎数和尾椎长度决定，而这一性状受到生殖轴发育相关的基因的调控。以哈萨克系绵羊来源的肥臀型地方绵羊品种在我国新疆、甘肃等西北地区广泛分布。肥臀型绵羊主要特点为臀部脂肪较多、尾椎发育不全、没有明显的尾巴。但是，国内外有关绵羊尾型的研究较少，目前还没有发现相关基因的突变与肥臀型绵羊尾型相关的报道，尚无通过基因标记的方式来鉴定绵羊尾型的方法。因此，设计分子标记试剂盒来鉴定绵羊的尾型，尤其是哈萨克系绵羊的无尾表型，以确定其是否为纯种羊具有重要意义和实用价值。

T基因为T-box转录因子家族成员，调控动物胚胎轴向生长的过程，进而对脊椎动物胚胎早期尾椎的发育和形成具有重要调控作用。前人研究发现，不同动物中该基因拥有多个可能影响尾椎发育相关的SNPs，且主要集中在该基因的T-box结构域中。T基因的突变已经被证实与牛、狗、猫、小鼠等动物的尾椎发育异常相关，且在狗、猫发现无尾性状与T基因的T-box结构域的错义突变相关。但是至今还没有该基因的SNPs与我国肥臀型绵羊“无尾”表型相关的报道。

发明内容

本发明公开一种用于检测绵羊尾型性状相关的单核苷酸的多态性标记SNPs及其应用。

本发明用于检测中国绵羊尾型性状相关的单核苷酸的多态性标记SNPs，其特征在于所述SNPs标记位于绵羊8号染色体定位于87804590/87804589的两个位点，该SNPs分子标记的多态性为G-G/C-T，两个位点完全连锁，基因型为G-G/G-G；G-G/C-T；C-T/C-T三种，其中C-T/ C-T只在中国肥臀型绵羊中检出，说明C-T/C-T基因型与绵羊无尾表型相关。

本发明的用于鉴定绵羊肥臀型羊品种的方法是：

1）提取待测绵羊血液基因组DNA；

2）以待测绵羊的基因组DNA为模板，利用特异性引物进行PCR扩增反应，获得扩增产物片段；

3）经测序检测PCR扩增产物片段的8:87804590/8:87804589处的碱基种类，若碱基种类为C-T/C-T，则判定待测绵羊为肥臀型无尾性状。

本发明用于鉴定绵羊肥臀型羊品种的方法使用的的特异性引物是SEQ ID No.1和SEQ ID No.2。

本发明的用于鉴定绵羊尾型性状试剂盒中包括有特异引物SEQ ID No.1和SEQ IDNo.2。