[发明专利]一种与大口黑鲈快速生长相关的单倍型标记及其应用

说明书

本发明公开了一种与大口黑鲈快速生长相关的单倍型标记及其应用，所述单倍型标记由位于大口黑鲈热激蛋白HSP70基因组序列SEQ ID NO：3的第1313位和2346位的SNP位点，以及第259位和2302碱基处的插入缺失突变位点组成，这4个位点完全连锁。利用本发明单倍型标记，在生产中保留第1313、259、2302、2346位的基因型分别为GA、T‑、Y‑、AT的大口黑鲈亲本(Y表示碱基片段CTGTCTTCTGTTCATAAGTGTC)，去除其他基因型的个体，便可快速获得生长速度快且遗传稳定的大口黑鲈品种。

技术领域

本发明属于分子生物技术领域，具体涉及一种与大口黑鲈快速生长相关的单倍型标记及其应用。

背景技术

大口黑鲈(Micropterus salmoides L.)，又称加州鲈，原产于北美洲，具有适应性强、生长快、病害少、耐低温、生长周期短以及味道鲜美等优点，是重要的淡水养殖鱼类之一。1983年从台湾引种到广东省，现在全国大部分地区均有养殖。但是，引种30多年来，由于生产单位不注重亲本留种须遵守的操作规程，也没能定期从原产地补充和引进亲本，导致养殖大口黑鲈遗传多样性降低，从而使生产性能降低，主要表现在生长速度下降、饵料转化效率低、抗病力也大幅下降。其中，生长速度关系到大口黑鲈产量的高低，养殖效益的大小。大口黑鲈生长退化的趋势直接制约着大口黑鲈养殖业的发展。因此，改良大口黑鲈生长速度的工作非常重要。

传统提高养殖鱼类生长速度的主要方法是挑选优良性状的亲鱼，挑选个体较大、身体健壮的鱼作为留种亲本，即根据表型来决定亲鱼是否留种。这种方法方便、快捷、简单，但受人为因素影响很大，加上大口黑鲈属于肉食性为主的鱼类，掠食性强，饵料不足是会互相残食，致使其生长悬殊较大。如此可见，仅从表型判断大口黑鲈亲本质量往往达不到理想的效果。随着分子生物学和遗传学的发展，已涌现出很多种遗传标记，如AFLP、RAPD、SSR、SNP等标记，其中，SNP标记因分布广泛，适宜高通量自动化分析，遗传稳定，日益成为遗传育种研究中首选的遗传标记。若这些遗传标记能与生产性状相关联在一起，即可实现从DNA水平上进行选择育种，克服了传统方法受人为因素影响大的不利因素，提高了选择的准确性，并且可实现在早期鉴定出具有优良性状的个体，筛选出优良的后备亲本，从而缩短育种周期，加快育种进程。通过发现与大口黑鲈快速生长有关的基因，大大提高快长亲本的筛选效果。

发明内容

本发明的一个目的在于提供一种与大口黑鲈快速生长相关的单倍型标记及其应用，该分子标记可作为大口黑鲈生长性状的可靠标记，便于进行早期选择，从而缩短世代间隔，提高选择强度，提高选育效率和准确性。

本发明的另一个目的在于提供一种快速生长大口黑鲈亲本的筛选方法。

本发明所采取的技术方案是：

大口黑鲈HSP70的氨基酸序列如SEQ ID NO：1所示。

大口黑鲈HSP70的cDNA序列如SEQ ID NO：2所示，其中第993位R为碱基G或A。

大口黑鲈HSP70的基因序列如SEQ ID NO：3所示，其中第1313位R为碱基G或A，第259位K为碱基T或者为碱基缺失，第2302位S为碱基片段CTGTCTTCTGTTCATAAGTGTC或者为碱基片段缺失，第2346位W为碱基A或T。

大口黑鲈生长速度相关的SNP位点或插入缺失突变位点，所述SNP位点位于HSP70基因组序列SEQ ID NO：3所示的第1313位和第2346位，所述插入缺失突变位点位于HSP70基因组序列SEQ ID NO：3所示的第259位和第2302位。

上述所述SNP位点或插入缺失突变位点在判断大口黑鲈生长快慢中的应用。

上述所述SNP位点或插入缺失突变位点在筛选快速生长大口黑鲈中的应用。

一种筛选快速生长大口黑鲈的方法，