[发明专利]血清脂质生物标志物在NSCLC早期诊断中的应用方法有效
申请号: | 201810093522.9 | 申请日: | 2018-01-31 |
公开(公告)号: | CN108680745B | 公开(公告)日: | 2021-06-15 |
发明(设计)人: | 陈莹蓉;戴利成;马志红;沈雄荣 | 申请(专利权)人: | 湖州市中心医院 |
主分类号: | G01N33/574 | 分类号: | G01N33/574;G01N30/02;G01N30/72 |
代理公司: | 浙江千克知识产权代理有限公司 33246 | 代理人: | 赵芳;张瑜 |
地址: | 313001*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 血清 生物 标志 nsclc 早期 诊断 中的 应用 方法 | ||
1.检测血清脂质生物标志物组合的产品在制备NSCLC早期诊断制品中的应用,其特征在于:所述血清脂质生物标志物组合为PE(16:0/16:1)、PE(16:0/18:3)、PE(16:0/18:2)、PE(18:0/16:0)、PE(17:0/18:2)、PE(18:0/17:1)、PE(17:0/18:1)、PE(20:5/16:0)、PE(18:0/18:1)、PE(18:1/20:4)、PE(18:0/20:3)、PC(15:0/18:1)、PC(16:1/20:5)和PC(18:0/20:1),所述血清脂质生物标志物组合通过如下步骤鉴定得到:
(1)收集NSCLC患者、肺良性病变患者和正常人的血清样本;
(2)对血清样本预处理,并采用超高效液相-四级杆-飞行时间质谱的方法检测各血清样本中脂质代谢标志物,获得脂质代谢指纹图谱;
(3)通过多元变量模式识别分析的方法进行NSCLC相关差异脂质代谢标志物的筛选;
(4)通过NSCLC差异脂质代谢物的KEGG分析和代谢通路分析,筛选出与脂质代谢物相关性最高的关键代谢通路;
(5)进行NSCLC差异脂质代谢物的“基因-酶-反应-代谢物”网络分析,获得NSCLC差异脂质代谢物网络图;
(6)综合NSCLC差异脂质代谢标志物筛选及代谢通路分析结果,筛选获得NSCLC血清早期诊断脂质生物标志物;
(7)对筛选出的NSCLC血清早期诊断脂质生物标志物重复步骤(1)-(6)进行靶标定量验证和确认。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:步骤(1)中的样本收集具体为:空腹采集NSCLC患者、肺良性病变患者和正常人肘部静脉血5mL于无菌促凝真空采血管中,2500r/min,4℃离心5min,取上层血清,保存于-80℃冰箱中待用。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:步骤(2)中血清样本预处理为:将低温保存的血清样本置室温解冻摇匀,取100μL的样本加入480μL甲基叔丁基醚-甲醇提取液,涡漩震荡30s,静置1h;3000r/min离心15min,取400μL甲基叔丁基醚层蒸干,100μL二氯甲烷:甲醇复溶,进行UPLC-Q-TOF/MS检测分析;同时每个样本各取10μL混合成质控样本,与样本同批次检测。
4.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:超高效液相-四级杆-飞行时间质谱采用Agilent 1290超高效液相色谱仪和AB Sciex 6600三重飞行时间质谱仪。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于:步骤(2)中液相色谱-质谱条件为:Phenomenex Kinetex C18 100 A柱,1.7μm,2.1×100mm,流速0.3ml/min,柱温为25℃;进样量为2μL,自动进样器温度4℃;流动相A:10mmol/L甲酸铵-40%水-60%乙腈,流动相B:10mmol/L甲酸铵-10%水-90%异丙醇;雾化气压力60psi,辅助气压力60psi,气帘气压力30psi,离子源温度550℃,喷雾电压5000V/-4500,去簇电压100V,碰撞电压10eV。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于:步骤(2)中采集的液相质谱数据包括一级质谱数据和二级质谱数据,其中在每个数据采集循环中,筛选出强度最强且大于100的分子离子进行采集对应的二级质谱数据。
7.根据权利要求4所述的应用,其特征在于:步骤(2)和步骤(3)之间还设有数据处理步骤,该步骤为:采用AB SCIEX Analyst TF 1.7.1数据采集软件记录每个血清样本的总离子流色谱图进行可视化检查;数据首先使用MSconventer转换为mzXML格式;使用XCMS做峰寻找、峰对齐数据处理。
8.根据权利要求1~7任一项所述的应用,其特征在于:步骤(3)中进行多元变量模式识别分析前需要进行数据预处理,具体为:对原始数据中的缺失值进行模拟,数值模拟方法为最小值二分之一法进行填补;数据标准化处理,利用每个样本的总离子流进行归一化。
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