[发明专利]一种与鸡屠体性状相关的SNP标记及其应用、检测引物、检测试剂盒

说明书

本发明涉及一种与鸡屠体性状相关的SNP标记及其应用、检测引物、检测试剂盒，属于生物育种技术领域。本发明首次发现如SEQ ID NO.1所示序列5’端起427位的GA突变位点，该的SNP位点对应于NCBI公布的鸡参考基因组Gallus_gallus‑5.0版本序列信息十六号染色体正义链第350006位脱氧核苷酸。该SNP标记中AA纯合型鸡个体的生长后期体重和产肉性能极显著高于GG和GA基因型个体，可用于鸡屠体性状的选育，能够在早期对于鸡的屠体性状进行选择，加快鸡的育种过程，节省生产成本。

技术领域

本发明涉及一种与鸡屠体性状相关的SNP标记及其应用、检测引物、检测试剂盒，属于生物育种技术领域。

背景技术

在家禽生产中，鸡的屠体性状是重要的经济性状，其能够反映鸡生长速度和产肉性能，因此，研究鸡的屠体性状具有重要的经济价值。

在相同的饲养环境条件下，影响鸡个体间12周龄体重和屠体性状差异的主要原因是遗传因素。目前，发现共计有分布在18条染色体上的41个数量性状基因座与12周龄体重相关，分布在22条染色体上的67个数量性状基因座与屠体重相关。但是大部分报道中这些数量性状基因座的置信区间比较大，很难通过图谱鉴定到影响12周龄体重和屠体性状的致因突变。因此，探讨影响12周龄体重和屠体性状的遗传结构具有重要的经济价值和生物学意义。

因此，为了鉴定表型和基因型之间的遗传联系，准确测定后备种鸡的基因型，以方便对12周龄体重和屠体性状进行早期选择，进而能更好地服务于家禽育种，节省生产成本，有必要研究开发新的遗传标记。

发明内容

本发明的目的是提供一种鸡屠体性状相关的SNP标记，该标记与鸡的生长性能及屠体性状相关性高。

本发明还提供了上述SNP标记的应用。

本发明还提供了一种用于检测鸡屠体性状的检测引物及检测试剂盒。

为了实现上述目的，本发明所采用的技术方案是：

一种与鸡屠体性状相关的SNP标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，5’端起第427位为G或A。

本发明首次发现上述的SNP位点，该分子标记位点对应于NCBI公布的鸡参考基因组Gallus_gallus-5.0版本序列信息十六号染色体正义链第350006位脱氧核苷酸，该SNP位点在之前没有被报道过，是一新发现的遗传分子标记，该标记与鸡的屠体性状相关性高。该标记可以作为分子探针，用于分子杂交，以判断待测样品的基因型。

上述的SNP标记在鸡生长性能或屠体性状选育中的应用。具体的，在鸡屠体性状选育种中的应用。更为具体的在鸡体重、屠体重、屠宰率、全净膛重、全净膛率、半净膛重、头重、爪重或双翅重性状选育中的应用。

本发明的新发现的SNP标记可以应用于12周龄体重和产肉性能的早期选择，辅助于鸡的育种，有助于节省生产成本并加快遗传选育进展，具有很大的经济应用价值和科研价值。

一种用于检测鸡屠体性状的检测引物，依据如SEQ ID NO.1所示的序列设计，所述检测引物的扩增片段包含该序列5’端起的第427位。该引物采用现有技术中常用的设计方法，也可以根据检测方法的不同进行设计。

具体的，所述引物序列如下所示：

SNP-F：5‘-AGGGAGCCTTGTTCAGTTGG-3’；

SNP-R：5‘-AGCAAGGAAATCCACAGCGA-3’。

包含上述检测引物的检测试剂盒。具体的，还包括dNTPs、PCR反应缓冲液、DNA聚合酶、SauI内切酶中的一种或几种。优选的，包括dNTPs、PCR反应缓冲液、DNA聚合酶和SauI内切酶。