[发明专利]牦牛全基因组SNP位点的应用及检测用引物组和试剂盒

说明书

本发明公开了提供牦牛全基因组的16个SNP位点在牦牛表型性状或分子育种分析中的应用，解决了现有技术中尚未有采用SNP位点对牦牛表型性状或分子育种分析的问题。本发明的16个SNP位点的核苷酸序列如SEQ ID No.1‑16所示。本发明还公开了用于检测该16个SNP位点的引物组及包括该引物组的试剂盒。本发明又公开了牦牛表型性状或分子育种分析的方法。本发明的16个SNP位点可为育种上下游过程提供支持，具有测定准确率高、易实现标准化和自动化检测等诸多优势。

技术领域

本发明属于畜牧技术领域，具体地涉及牦牛全基因组SNP位点的应用及检测用引物组和试剂盒。

背景技术

牦牛是分布于以青藏高原为中心，及其毗邻的高山、亚高山地区的特有牛种，能充分利用高寒草地的牧草资源，对高寒草地的生态环境条件具有极强的适应性。在空气稀薄、牧草生长期短、寒冷、枯草期长的恶劣环境条件下生活自如，繁衍后代，为当地牧民提供奶、肉、毛、役力、燃料等生产生活必需品，是当地畜牧业经济中不可或缺的，可称之为“全能”的家畜。牦牛在遗传资源上是一个极为宝贵的基因库。然而，中国牦牛数量和品种类群多，分布广，各牦牛品种产肉产奶，体型特征等表型各不相同。而中国地方牦牛品种基因组变异信息的不完整，是导致我国牦牛品种的育种及相关研究局限的重要原因之一。

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是生物可遗传的变异中最常见的一种。SNP是公认的第三代遗传标志，许多表型差异、对疾病的易感性等等都可能与SNP有关。且从实验操作来看，通过SNP发现表型相关基因突变要比通过家系来得容易；有些SNP并不直接导致相关性状，但由于它与某些相关基因相邻，可成为重要的标记。目前并未见关于跟牦牛体重相关的SNP标记位点的报道。

因此，提供牦牛表型相关SNP的位点信息，用于在牦牛表型性状或牦牛分子育种分析中，成为了本领域技术人员亟待解决的问题。

发明内容

本发明的目的之一在于，提供牦牛全基因组的16个SNP位点在牦牛表型性状或分子育种分析中的应用，以解决现有技术中尚未有采用SNP位点对牦牛表型性状或分子育种分析的问题。

本发明的目的之二在于用于检测该16个SNP位点的引物组。

本发明的目的之三在于提供包括该引物组的试剂盒。

本发明的目的之四在于提供牦牛表型性状或分子育种分析的方法。

为实现上述目的，本发明采用的技术方案如下：

本发明所述的牦牛全基因组的16个SNP位点在牦牛表型性状或分子育种分析中的应用，所述16个SNP位点如下：

AX-174702570，核苷酸序列如SEQ ID No.1所示；

AX-174961896，核苷酸序列如SEQ ID No.2所示；

AX-174407967，核苷酸序列如SEQ ID No.3所示；

AX-174402854，核苷酸序列如SEQ ID No.4所示；

AX-174929694，核苷酸序列如SEQ ID No.5所示；

AX-174547362，核苷酸序列如SEQ ID No.6所示；

AX-174734142，核苷酸序列如SEQ ID No.7所示；

AX-174706158，核苷酸序列如SEQ ID No.8所示；

AX-174783962，核苷酸序列如SEQ ID No.9所示；