[发明专利]用于检测眼内液中烟曲霉菌的LAMP引物组合及应用在审
申请号: | 201810131895.0 | 申请日: | 2018-02-08 |
公开(公告)号: | CN110129467A | 公开(公告)日: | 2019-08-16 |
发明(设计)人: | 陶勇 | 申请(专利权)人: | 北京智德医学检验所有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅;何叶喧 |
地址: | 101300 北京市顺义区仁和*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 曲霉菌 检测 引物组合 眼内液 应用 单链DNA分子 待测样本 出烟 感染 | ||
1.引物组合,由引物F3、引物B3、引物FIP、引物BIP、引物LF和引物LB组成;
所述引物F3为如下(a1)或(a2):
(a1)序列表的序列1所示的单链DNA分子;
(a2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子;
所述引物B3为如下(a3)或(a4):
(a3)序列表的序列2所示的单链DNA分子;
(a4)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子;
所述引物FIP为如下(a5)或(a6):
(a5)序列表的序列3所示的单链DNA分子;
(a6)将序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列3具有相同功能的DNA分子;
所述引物BIP为如下(a7)或(a8):
(a7)序列表的序列4所示的单链DNA分子;
(a8)将序列4经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列4具有相同功能的DNA分子;
所述引物LF为如下(a9)或(a10):
(a9)序列表的序列5所示的单链DNA分子;
(a10)将序列5经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列5具有相同功能的DNA分子;
所述引物LB为如下(a11)或(a12):
(a11)序列表的序列6所示的单链DNA分子;
(a12)将序列6经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列6具有相同功能的DNA分子。
2.权利要求1所述的引物组合的应用,为如下(b1)或(b2)或(b3)或(b4):
(b1)鉴定或辅助鉴定待测真菌是否为烟曲霉菌;
(b2)制备用于鉴定或辅助鉴定待测真菌是否为烟曲霉菌的试剂盒;
(b3)检测待测样本是否感染了烟曲霉菌;
(b4)制备用于检测待测样本是否感染了烟曲霉菌的试剂盒。
3.含有权利要求1所述引物对的试剂盒;所述试剂盒的用途为如下(c1)或(c2):
(c1)鉴定或辅助鉴定待测真菌是否为烟曲霉菌;
(c2)检测待测样本是否感染了烟曲霉菌。
4.权利要求4所述试剂盒的制备方法,包括将各条引物单独包装的步骤。
5.鉴定待测真菌是否为烟曲霉菌方法,包括如下步骤:以待测真菌的基因组DNA为模板,采用权利要求1所述的引物组合进行LAMP扩增反应,如果采用所述引物组合可以实现以所述基因组DNA为模板的阳性扩增、待测真菌为烟曲霉菌,如果采用所述引物组合不能实现以所述基因组DNA为模板的阳性扩增、待测真菌为非烟曲霉菌。
6.鉴定待测真菌是否为烟曲霉菌方法,包括如下步骤:检测待测真菌的基因组DNA中是否存在权利要求1所述的引物组合的靶序列,如果所述基因组DNA中存在所述引物组合的靶序列、待测真菌为烟曲霉菌,如果所述基因组DNA中不存在所述引物组合的靶序列、待测真菌为非烟曲霉菌。
7.检测待测样本是否感染了烟曲霉菌的方法,包括如下步骤:以待测样本的总DNA为模板,采用权利要求1所述的引物组合进行LAMP扩增反应,如果采用所述引物组合可以实现以所述总DNA为模板的阳性扩增、待测样本感染了烟曲霉菌,如果采用所述引物组合不能实现以所述总DNA为模板的阳性扩增、待测样本没有感染烟曲霉菌。
8.检测待测样本是否感染了烟曲霉菌的方法,包括如下步骤:检测待测样本的总DNA中是否存在权利要求1所述的引物组合的靶序列,如果所述总DNA中存在所述引物组合的靶序列、待测样本感染了烟曲霉菌,如果所述总DNA中不存在所述引物组合的靶序列、待测样本没有感染烟曲霉菌。
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