[发明专利]调控陆地棉株高的基因及其应用

说明书

本发明涉及植株株高基因领域，具体而言，涉及调控陆地棉株高的基因及其应用。调控陆地棉株高的基因，其CDS的碱基序列如SEQ ID NO.1所示，该基因的一段特异碱基序列如SEQ ID NO.2所示。本发明利用355份陆地棉自然群体，基于SLAF‑seq简化基因组测序技术，开发覆盖棉花全基因组的较大数目SNPs，通过对株高性状的3年2点的表型鉴定，采用GWAS的方法解析株高的遗传基因，筛选得到调控陆地棉株高的基因。本发明还利用病毒诱导基因沉默技术对该基因的功能进行了验证，说明可通过调控该基因的表达情况控制株高，为开展陆地棉分子育种奠定基础。

技术领域

本发明涉及植株株高基因领域，具体而言，涉及调控陆地棉株高的基因及其应用。

背景技术

棉花(Gossypium spp.)是世界上最重要的纤维作物，也是我国最主要的经济作物之一。我国是主要的产棉大国和棉纺织品出口大国，因此，棉花在我国国民经济中占有十分重要的地位。陆地棉(Gossypium hirsutum L.)是种植面积最大的栽培种，具有高产、适应性强、纤维品质中等优异性状，在世界70多个国家和地区有种植，其种植面积占棉花总面积的95％以上。棉花株高与产量、品质等存在相关关系,是重要的农艺性状之一。重要的是，棉花获得高产要以合理密植为中心，建立合理的群体结构，其中一个很重要的指标就是株高。

随着分子技术的发展和遗传连锁图谱的构建，人们对棉花株高QTL进行了更为深入的研究。Shappley等利用陆地棉种内杂交F2群体定位到2个株高QTL，分别位于第6和第23连锁群上；宋宪亮等利用TM-1和海岛棉7124构建的BC1S1群体，定位到了3个控制株高的QTL,解释9.56％～22.05％的表型变异。于霁雯利用中棉所36和海7124构建的F 2:3家系群体，检测到2个株高QTL，分别位于染色体A2和A11上，解释的表型变异分别为9.18％和9.48％。这些研究所用的群体遗传背景复杂，QTL之间存在互作，QTL的定位不精确。

而染色体片段代换系(CSSLs)遗传背景与轮回亲本相似，基因组中只含有一个或几个小的供体亲本的染色体片段。利用该类群体检测QTL,可有效减少遗传背景干扰,提高QTL定位的准确性。兰孟焦等利用中棉所45和海岛棉海1构建陆海染色体片段代换系(BC4F2、BC4F3)获得7个株高QTL。梁燕通过中棉所36和海岛棉海1构建的三个代换系群体(BC5F3,BC5F3:4和BC5F3:5)群体检测到1个株高QTL,与标记MUSS563紧密连锁的qPH-15-19解释7.90％的表型变异。

但现有的关于株高的标记基因仍不如人意。

有鉴于此，特提出本发明。

发明内容

本发明的第一目的在于提供调控陆地棉株高的基因，本发明利用355份陆地棉自然群体，基于SLAF-seq简化基因组测序技术，开发覆盖棉花全基因组的较大数目SNPs，通过对株高性状的3年2点的表型鉴定，采用GWAS的方法解析株高的遗传基因，筛选得到调控陆地棉株高的基因，其CDS全长基因序列如SEQ ID NO.1所示，其特异性序列如SEQ ID NO.2所示。

本发明的第二目的在于提供所述的调控陆地棉株高的基因在调控陆地棉株高方面的应用，即可以通过促进或者抑制该基因的表达来实现陆地棉株高的调控。

为了实现本发明的上述目的，特采用以下技术方案：

调控陆地棉株高的基因，碱基序列如SEQ ID NO.1所示。

本发明还提供了一段调控陆地棉株高的特异性基因片段，碱基序列如SEQ IDNO.2所示。