[发明专利]一种鸡CEL基因启动子99bp indel多态性标记检测试剂盒及其应用

说明书

本发明涉及一种鸡CEL基因启动子99bp indel多态性标记检测试剂盒及其应用，属于分子遗传学育种技术领域。本发明发现了CEL基因启动子99bp indel多态性标记，可用于鸡的辅助选择和分子育种；具体的，依据如SEQ ID NO.1所示的序列设计扩增查无包含该序列5‘端起的第183‑281位的引物，根据扩增产物的大小判断第183‑281位缺失/不缺失，进而判断检测样本为DD、II或ID基因型，通过加强对DD基因型个体的选育，来提高地方鸡的屠宰性能。本发明建立的应用方法无需酶切，分辨率高、判型准确、操作简单、成本低、周期短，不需要特殊的仪器，易推广普及。

技术领域

本发明涉及一种鸡CEL基因启动子99bp indel多态性标记检测试剂盒及其应用，属于 生物育种技术领域。

背景技术

生长性能与屠体性状作为畜禽主要的经济性状，如何在种质特性不改变的情况下提高 地方畜禽品种的经济性状，维护地方畜禽的可持续发展，借助现代分子标记就显得尤为重 要。

羧基酯脂肪酶(CEL)，是胰腺腺泡外分泌的一种脂肪酶，它们是无活性的酶原，但分 泌到十二指肠后，经胆盐激活后参与水解各种脂酯(胆固醇酯、甘油三酯、磷酯、脂溶性维生素等)。研究表明CEL基因可变数目串联重复序列突变后，水解的功能减退或丧生， 可以导致MODY-胰外分泌综合征、胰岛素依赖型糖尿病(1型糖尿病)或非胰岛素依赖型 糖尿病(2型糖尿病)及酒精性胰腺炎等胰腺外分泌疾病。

因此，CEL基因与家禽的生长性状及屠宰性状可能有较大的联系，但是该基因的突变 及其对于家禽生长及屠宰相关性状的影响还未有报道。

发明内容

本发明的目的是提供一种鸡CEL基因启动子99bp indel多态性标记，该标记与鸡的生 长性能及屠体性状相关性高。

本发明还提供了上述多态性标记的应用。

本发明还提供了上述CEL基因启动子99bp indel多态性标记的检测引物及检测试剂盒。

为了实现上述目的，本发明所采用的技术方案是：

一种鸡CEL基因启动子99bp indel多态性标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示， 5‘端起第183-281位插入或缺失。

上述的多态性标记位于CEL基因的启动子部位，99bp缺失发生在CEL基因上游4309与4310位点之间，鸡基因序列的NCBI GenBank登录号NC_006104。本发明首次检测了CEL基因启动子99bp indel多态性标记在不同品种中的分布，并通过分析其在不同品种鸡 的基因型分布及等位基因频率，及其与F₂资源群体经济性状进行关联分析发现该多态性标 记与鸡生长性状密切相关，为筛选出纯合高品质的地方鸡群体奠定基础。该多态性标记可 以作为分子探针，用于分子杂交，以判断待测样品的基因型。

上述的多态性标记在鸡生长性状和/或屠宰性状选育中的应用。具体的，在鸡体重、胫 长、胫围、胸宽、胸骨长、全净膛、半净膛、皮脂、胸肌重、腿重、腿肌重、皮脂率、头 率、头重、心脏率、肌胃率、胸肌重率和/或腿失水率性状选育中的应用。优选的，在鸡胫 长、胫围、胸宽、胸骨长等生长性状及全净膛、皮脂、胸肌重、腿重、肌胃率、胸肌重率、 腿失水率、心脏率等屠宰性状选育中的应用。

本发明的新发现的多态性标记可用于鸡的辅助选择和分子育种，有助于节省生产成本 并加快遗传选育进展，具有很大的经济应用价值和科研价值。

上述的多态性标记的应用是通过检测如SEQ ID NO.1所示序列5‘端起第183-281位插 入或缺失，选择该片段缺失纯合型的鸡个体，弃去该片段不缺失或者单染色体缺失基因型 的鸡个体。本发明中发现如SEQ ID NO.1所示序列5‘端起第183-281位缺失纯合型的鸡体 重及屠宰性状明显优于该片段不缺失或者单染色体缺失基因型的鸡个体。