[发明专利]用于检测和鉴定MREJ型xxi的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的序列

权利要求书

1.检测包括MREJ型xxi核酸的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）（MRSA）的试剂盒或组合物，所述金黄色葡萄球菌包括包含mecA同系物基因mecA_LGA251的葡萄球菌盒染色体mec（SCCmec）元件，所述SCCmec盒被插入金黄色葡萄球菌染色体DNA，从而产生包括SEQ ID NO:1的核苷酸149-774的多态性右侧末端连接（MREJ）型xxi序列，所述多态性右侧末端连接（MREJ）型xxi序列包括多态性右侧末端序列和靠近所述多态性右侧末端序列的染色体DNA，所述试剂盒或组合物包括:

第一扩增引物，所述第一扩增引物长度在10和45个核苷酸之间，其中所述第一扩增引物在标准PCR条件下与所述包括SEQ ID NO:1的核苷酸149-774的MREJ型xxi序列的多态性右侧末端序列特异地杂交，和

第二扩增引物，所述第二扩增引物长度在10和45个核苷酸之间，其中所述第二扩增引物在标准PCR条件下与金黄色葡萄球菌的orfX基因杂交，并且其中所述第一和第二扩增引物一起在所述标准PCR条件下在存在包括MREJ型xxi核酸的MRSA的情况下产生对MREJ 型xxi核酸的右侧末端连接特异的扩增子。

2.权利要求1所述的试剂盒或组合物，进一步包括探针，其中所述探针与所述MREJ型xxi核酸的扩增子在所述标准PCR条件下特异地杂交。

3.权利要求1所述的试剂盒或组合物，进一步包括引物对，所述引物对特异地与SEQ IDNO:156内的mecA序列杂交，并能扩增SEQ ID NO:156内的mecA序列。

4.权利要求1所述的试剂盒或组合物，进一步包括引物对，所述引物对特异地与SEQ IDNO:157内的mecC序列杂交，并能扩增SEQ ID NO:157内的mecC序列。

5.权利要求1所述的试剂盒或组合物，进一步包括引物对，所述引物对特异地与SEQ IDNO:158内的nuc序列杂交，并能扩增SEQ ID NO:158内的nuc序列。

6.权利要求1所述的试剂盒或组合物，进一步包括一种或多种另外的扩增引物，其中所述一种或多种另外的扩增引物长度在10和45个核苷酸之间，并且其中所述一种或多种另外的扩增引物与来自MREJ型i至xx MRSA的一种或多种多态性SCCmec右侧末端序列特异地杂交。

7.权利要求6所述的试剂盒或组合物，其中所述一种或多种多态性SCCmec右侧末端序列选自SEQ ID NOs:5至29。

8.权利要求1所述的试剂盒或组合物，其中所述第一扩增引物包括SEQ ID NO:2。

9.权利要求8所述的试剂盒或组合物，其中所述第二扩增引物包括SEQ ID NO:3。

10.权利要求9所述的试剂盒或组合物，进一步包括探针，其中所述探针包括SEQ IDNO:4或82。

11.权利要求10所述的试剂盒或组合物，其中所述探针包括荧光发射体部分和荧光猝灭剂部分。

12.权利要求1所述的试剂盒或组合物，其中所述第一扩增引物处于冻干的形式。