[发明专利]从微量样品中提取和消化蛋白质的方法、定量检测及应用在审
申请号: | 201810146491.9 | 申请日: | 2018-02-12 |
公开(公告)号: | CN110161155A | 公开(公告)日: | 2019-08-23 |
发明(设计)人: | 任艳;范徉;梁莉媛;林志龙;张可人;李思奇;刘斯奇 | 申请(专利权)人: | 深圳华大生命科学研究院 |
主分类号: | G01N30/06 | 分类号: | G01N30/06;G01N30/72;G01N30/88 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 赵天月 |
地址: | 518083 广东省深*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 蛋白质 裂解液 蛋白变性剂 超声处理 定量检测 组织样品 裂解 酶解 质谱 胰蛋白酶 蛋白酶抑制剂 烷基化试剂 消化 碱性试剂 酸性试剂 微量样品 微量组织 变性剂 还原剂 兼容性 提取量 挥发 上机 温育 肽段 应用 样本 | ||
1.一种从微量样品中提取和消化蛋白质的方法,其特征在于,包括:
向样品中加入裂解液,进行裂解,所述裂解液包括蛋白变性剂和蛋白酶抑制剂,所述裂解液中含有可挥发的碱性试剂,所述蛋白变性剂为可适用于质谱上机鉴定的质谱兼容性变性剂;
将裂解后的组织样品进行超声处理;
向超声处理后的样品中加入还原剂进行温育,然后加入烷基化试剂进行烷基化处理;
向经过烷基化处理后的溶液中加入胰蛋白酶进行酶解;
向酶解后的样品中加入酸性试剂,然后离心取上清,得到肽段溶液。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述超声处理为接触式超声处理,优选为探针超声处理;
所述超声处理的时间为1~2分钟,功率为40~100W;
任选地,所述超声处理按照超声2~3秒,停止2~3秒重复。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述蛋白变性剂为RapiGest或脱氧胆酸钠;
任选地,所述RapiGest的质量浓度为1~5%,所述脱氧胆酸钠的质量浓度为1~5%,
所述蛋白酶抑制剂为苯甲基磺酰氟(PMSF)。
4.根据权利要求1~3任一项所述的方法,其特征在于,所述可挥发的碱性试剂为第一弱碱试剂,所述第一弱碱试剂包括选自碳酸氢铵、氨水、乙酸铵中的至少一种;
任选地,所述第一弱碱溶液为碳酸氢铵。
5.根据权利要求1~4任一项所述的方法,其特征在于,加入所述还原剂后在45~65℃条件下,温育30分钟~2小时;
任选地,所述还原剂为二硫苏糖醇或三(2-羧乙基)膦溶液;
任选地,所述二硫苏糖醇溶液的作用浓度为5mM~10mM,所述三(2-羧乙基)膦溶液的作用浓度为5mM~10mM。
6.根据权利要求1~5任一项所述的方法,其特征在于,加入烷基化试剂后在室温避光放置30分钟~45分钟;
任选地,所述烷基化试剂为碘乙酰胺或甲基甲硫甲基亚砜溶液;
任选地,所述碘乙酰胺溶液的作用浓度为20mM~40mM,所述甲基甲硫甲基亚砜溶液的作用浓度为20mM~40mM。
7.根据权利要求1~6任一项所述的方法,其特征在于,在加入胰蛋白酶酶解之前加入第二弱碱试剂,所述第二弱碱试剂包括选自碳酸氢铵、氨水、乙酸铵中的至少一种;
任选地,所述第二弱碱试剂为碳酸氢铵。
8.根据权利要求1~7任一项所述的方法,其特征在于,所述酶解的条件为37℃下水浴4~8小时;
任选地,所述胰蛋白酶的浓度为0.1μg/μL~0.3μg/μL;
任选地,所述胰蛋白酶为测序级的胰蛋白酶;
任选地,所述酸性试剂选自甲酸(FA)、三氟乙酸、乙酸、柠檬酸中的至少一种;
任选地,所述方法可适用于低至0.1μg蛋白样品的提取和消化;
任选地,所述微量样品为组织样品或者细胞样品,优选为切片组织样品或穿刺组织样品。
9.一种对微量样品中提取的肽段进行定量检测的方法,其特征在于,
将权利要求1~8任一项所述的肽段溶液利用液相色谱-质谱联用进行非依赖性数据(DIA)检测。
10.一种用于从微量组织中提取和消化蛋白质的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括试剂套装,所述试剂套装包括:
试剂A,所述试剂A为裂解液,所述裂解液包括蛋白变性剂和蛋白酶抑制剂,所述蛋白变性剂为RapiGest或脱氧胆酸钠,所述蛋白酶抑制剂为苯甲基磺酰氟(PMSF),所述裂解液中含有可挥发的碱性试剂,所述可挥发的碱性试剂选自碳酸氢铵、氨水、乙酸铵中的至少一种,
试剂B,所述试剂B为二硫苏糖醇或三(2-羧乙基)膦溶液,
试剂C,所述试剂C为碘乙酰胺或甲基甲硫甲基亚砜MMTS溶液,
试剂D,所述试剂D为胰蛋白酶溶液,
当试剂B为二硫苏糖醇溶液时,试剂C为碘乙酰胺溶液,当试剂B为三(2-羧乙基)膦溶液时,试剂C为甲基甲硫甲基亚砜溶液;
任选地,所述试剂套装进一步包括试剂E,所述试剂E为酸性试剂,所述酸性试剂选自甲酸(FA)、三氟乙酸、乙酸、柠檬酸中的至少一种;
任选地,所述试剂套装进一步包括试剂F,所述试剂F选自碳酸氢铵、氨水、乙酸铵中的至少一种;
任选地,所述RapiGest的质量浓度为1~5%,所述脱氧胆酸钠的质量浓度为1~5%;
任选地,所述二硫苏糖醇溶液的浓度为5mM~10mM,所述三(2-羧乙基)膦溶液的作用浓度为5mM~10mM;
任选地,所述碘乙酰胺溶液的作用浓度为20mM~40mM,所述甲基甲硫甲基亚砜溶液的作用浓度为20mM~40mM;
任选地,所述胰蛋白酶溶液的作用浓度为0.1μg/μL~0.3μg/μL。
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