[发明专利]基于POCT模式的HLA-B*5801基因型快速检测试剂盒在审

专利信息
申请号: 201810152060.3 申请日: 2018-02-14
公开(公告)号: CN109251973A 公开(公告)日: 2019-01-22
发明(设计)人: 贺庭祯;罗德朋;向霄;熊伟;黎帮勇;钟越;刘黎;董锐;崔奇新;杨园 申请(专利权)人: 重庆京因生物科技有限责任公司
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 代理人: 王文君;黄爽
地址: 400084 重庆市大渡口区*** 国省代码: 重庆;50
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摘要:
搜索关键词: 快速检测试剂盒 准确检测 基因型 试剂盒 检测 样本 荧光定量PCR引物 标准阳性模板 口腔脱落细胞 反应缓冲液 检测灵敏度 细胞裂解液 基因组DNA 患者用药 即时检测 检测结果 样品收集 采样棒 提纯 准确率 探针 耗时 医生
【说明书】:

发明提供一种基于POCT模式的HLA‑B*5801基因型快速检测试剂盒,所述试剂盒至少含有用于检测HLA‑B*5801(rs9263726)基因型的荧光定量PCR引物和探针(SEQ ID NO:1‑4)及细胞裂解液,此外还可包括dNTPs、DNA聚合酶、Mg2+、反应缓冲液、标准阳性模板、采样棒、样品收集管等。本试剂盒可实现即时检测,无需DNA提纯,可将样本直接加入试剂中进行PCR反应,特别适合DNA含量较低样本(如口腔脱落细胞)的快速、准确检测,检测准确率达99%以上,检测灵敏度高,可准确检测低至0.125ng基因组DNA;整个检测耗时短,1小时内可得检测结果,能在第一时间给医生提供用药依据,降低患者用药风险。

技术领域

本发明涉及分子生物学领域,具体地说,涉及一种基于POCT模式的HLA-B*5801基因型快速检测试剂盒。

背景技术

人类白细胞抗原HLA是一组位于第6号染色体上的基因,是人类最复杂的遗传多态性系统,其多态性分布存在明显的族群特征。

别嘌呤醇可抑制尿酸生成,也是最常引起皮肤不良反应的药物之一。据统计,约2%服用别嘌呤醇的患者在临床上出现轻重不一的皮肤过敏反应,虽然不足1%的病例会转变为药物高敏综合征、Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症在内的严重皮肤不良反应,但其死亡率高达10%-40%。

研究发现,具有遗传特异性的药物毒副作用常与人类白细胞抗原基因密切相关。HLA-B*5801(rs9263726)基因和高血次黄嘌呤浓度均为别嘌呤醇特异性T淋巴细胞反应的影响因素。由于,HLA-B基因是人类基因组中最具多形性的基因,不同的等位基因编码的HLA-B分子可能对别嘌呤醇的亲和力不同,而高亲和力的HLA-B分子更易与别嘌呤醇结合从而引起过敏反应。

中国汉族人群属于携带HLA-B*5801等位基因频率较高的人群,其中南方汉族人群携带HLA-B*5801等位基因概率为8.35%,北方汉族人群携带HLA-B*5801等位基因概率为5.53%。2008年,中国台湾地方行政部门就已经发布指令,在服用别嘌醇前必须进行HLA-B*5801检测;美国风湿病学会在2012年的痛风诊治指南中也建议亚裔人群在服用别嘌醇前检测HLA-B*5801基因。因此,快速、准确的HLA-B基因分型检测对服用别嘌呤患者的个体化用药有着重大的临床意义。

目前,国内外对HLA-B*5801等位基因进行分析检测的方法主要有聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP),测序法和荧光定量PCR法。测序法对检测结果具有很高的精度,其依赖大型精密仪器设备、固定实验室以及专业操作人员,因此,这种检测方法成本高,步骤繁琐并且耗时长,在临床上很难进行推广。PCR-SSCP法是一种较经典的方法,通过几对HLA-B*5801特异性引物扩增DNA并通过电泳结果来分析,该方法污染风险大、检测周期长,也不适合临床使用。CN103805701A公开了一种荧光定量PCR检测方法。虽然该方法具有成本低,时间短和结果分析简单的优点,但是由于该反应体系只能扩增纯化后的基因组DNA样本,必须采用多步骤多管操作,在临床推广上也不理想。因此这些常规的检测技术都难以满足国内携带HLA-B*5801突变基因的人群对HLA-B*5801基因检测快速、准确的要求。

发明内容

本发明的目的是提供一套用于检测HLA-B*5801(rs9263726)基因型的荧光定量PCR引物和探针。

本发明的另一目的是提供一种基于POCT模式的HLA-B*5801(rs9263726)基因型快速检测试剂盒。

为了实现本发明目的,本发明提供一套用于检测HLA-B*5801(rs9263726)基因型的荧光定量PCR引物和探针,包括上游引物、下游引物、野生型探针和突变型探针,它们的核苷酸序列分别如下(SEQ ID NO:1-4):

上游引物:5’-GTGGGTTACACCTTGGCCC-3’

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