[发明专利]一种用于检测强直性脊柱炎易感风险位点的试剂盒

说明书

一种用于检测强直性脊柱炎易感风险位点的试剂盒，属于分子生物学和医学领域。所述的试剂盒用于检测如下位点基因型：rs6600247、rs10865331、rs10510607、rs12504282、rs11742270、rs30187、rs10045403、rs10050860、rs639575、rs8006884、rs2297518、rs9901869、rs8070463和/或rs2836883。本发明的有益效果在于，上述试剂盒用于检测多个中国汉族人群特异的易感位点组合，以此协助治疗。

技术领域

本发明涉及一种用于检测强直性脊柱炎易感风险位点的试剂盒，属于分子生物学和医学领域。

背景技术

强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis，AS)是脊柱关节病(spondyloarthropathies，SpA)的原型，它主要的临床表现为隐匿起病的炎性腰背痛、晨僵，后期导致脊柱活动受限，可合并外周关节炎、肌腱末端、韧带附着点炎等表现，疾病晚期出现脊柱强直或畸形，生活质量严重下降。目前亚洲人群强直性脊柱炎患病率为0.23％，患者人数超过500万人。目前认为遗传因素、肠道菌群、免疫紊乱均参与AS发病，其中，基于三分之一的AS患者有家族史、AS与HLA-B27基因强相关，遗传因素被认为在AS发病中占据重要地位。既往的基于双胞胎的研究提示，遗传因素在AS的发病机制中的作用可达90％。在AS疾病易感基因的研究过程中，HLA-B27是最早也是被认为与AS的家族聚集性的遗传相关的重要的基因，而整个MHC占的比例约是40-50％。MHC又叫主要组织相容性复合体，是存在于脊椎动物某一染色体上编码主要组织相容性抗原的一组紧密连锁的基因群，与免疫应答、免疫调节和移植排斥等有关。研究认为HLA-B27在疾病的总的遗传风险大约占20-30％。

近年来，研究者对AS遗传易感性的认知，由于全基因组关联分析研究(genome-wide association study,GWAS)的普及应用得到了前所未有的提高，目前在欧洲人群中已有超过40余个AS疾病易感区域被报道，这为研究AS的发生和发展的机制开辟了全新的思路。GWAS是基于“常见疾病，常见变异”的研究思路，认为复杂疾病是多个易感基因在散发无亲缘关系的人群中分布频率不同、结合环境等多方面因素发生的；通过在病例和对照人群中，对全基因组范围的位点进行全扫并分析，寻找在病例组与对照组中最小等位基因频率(minor allele frequency，MAF)相差达到统计学差异的易感SNP，认为其与疾病易感风险相关，从而进一步探讨疾病的致病或易感基因。

GWAS检测的位点，多为单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism，SNP),其主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性，它是人类可遗传的变异中最常见的一种，占所有已知多态性的90％以上。SNP在人类基因组中广泛存在，平均每500～1000个碱基对中就有1个，估计其总数可达300万个甚至更多。GWAS报道的SNP多位于基因以外的非编码序列上。欧洲人群关于AS易感位点的GWAS研究最早在2007年，使用包含14,436个SNP的全基因组芯片对1000例AS病人及1500例对照进行全扫及验证，发现了IL23R和ARTS1(ERAP1)这两个基因是AS的新易感基因。2010年采用IlluminaHumHap370芯片对澳大利亚、英国和北美等大样本欧洲人群进行全扫并验证，除了确认此前报道的ERAP1和IL-23R基因，还报道了2p15，21q22，ANTXR2，IL1R2等易感区域。2011年通过对前期芯片数据的整合及进一步大样本研究，报道了三个新的易感区域：RUNX3,LTBR-TNFRSF1A,IL12B；并发现ERAP1与HLA-B27在AS发病中存在基因间相互作用，ERAP1仅在HLA-B27阳性患者中与AS存在相关性。2013年通过Immunochip免疫芯片对9069例AS病人及13578例对照进行全扫筛选，进一步发现13个AS易感区域；而2016年通过增加对照例数，又新报道了17个AS易感区域。多个欧洲人群的GWAS研究，至今已报道超过40个易感区域、64个达到或接近统计学差异的易感位点，这些易感位点揭示了炎症反应、白介素23-白介素17轴、免疫反应等多个通路参与AS发病。