[发明专利]一种针对尿液样本的蛋白质组学质谱检测方法在审
申请号: | 201810172358.0 | 申请日: | 2018-03-01 |
公开(公告)号: | CN108387666A | 公开(公告)日: | 2018-08-10 |
发明(设计)人: | 林琳 | 申请(专利权)人: | 南方科技大学 |
主分类号: | G01N30/06 | 分类号: | G01N30/06;G01N30/72;G01N30/88 |
代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 巩克栋 |
地址: | 518000 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 可变窗口 尿液样本 蛋白质组学 质谱检测 母离子 蛋白质 采集 疾病标志物 碎裂 传统数据 非依赖性 碎片信息 循环扫描 高通量 灵敏度 全扫描 依赖型 重现性 最大化 检测 尿液 色谱 相等 遗漏 样本 扫描 分析 重现 应用 | ||
1.一种针对尿液样本的蛋白质组学质谱检测方法,其特征在于,所述方法利用可变窗口的数据非依赖性质谱采集方法,其每个循环扫描模式包含一个一级全扫描和30个可变窗口的数据非依赖性二级扫描,所述30个可变窗口如下:m/z 349-374,m/z 374-393,m/z393-408,m/z 408-420,m/z 420-432,m/z 432-442,m/z 442-454,m/z 454-465,m/z 465-477,m/z 477-488,m/z 488-499,m/z 499-509,m/z 509-521,m/z 521-532,m/z 532-545,m/z 545-558,m/z 558-571,m/z 571-589,m/z 589-604,m/z 604-620,m/z 620-638,m/z638-659,m/z 659-679,m/z 679-701,m/z 701-730,m/z 730-768,m/z 768-810,m/z 810-857,m/z 857-947,m/z 947-1489。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述一级全扫描的扫描范围为m/z 350-1400;
优选地,所述方法采用的检测系统为:纳流液相色谱-四极杆-静电场轨道阱-线性离子阱三合一高分辨质谱系统。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述纳流液相色谱的色谱柱为自制纳流C18色谱柱;上样量为1-5μL;流速为200-300nL/min。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的方法,其特征在于,所述纳流液相色谱以0.1%的甲酸水溶液为A流动相,以0.1%甲酸-乙腈溶液为B流动相。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的方法,其特征在于,所述纳流液相色谱的分析梯度为:0-2min,3%-7%B流动相;2-52min,7%-22%B流动相;52-62min,22%-35%B流动相;62-64min,35%-90%B流动相;64-80min,90%B流动相。
6.根据权利要求1-5中任一项所述的方法,其特征在于,所述高分辨质谱系统选择的离子源为纳喷雾离子源,正离子模式;喷雾电压为1.8-2.2KV;离子传输管温度为280-350℃。
7.根据权利要求1-6中任一项所述的方法,其特征在于,所述可变窗口的数据非依赖性质谱采集方法中质谱条件:一级全扫描,扫描范围:m/z 350-1400;一级检测:轨道阱质量分析器,分辨率60K,选择模式:四级杆;隔离窗口:30个可变窗口的数据非依赖性二级扫描;碎裂模式:高能碰撞解离,碎裂能量为30%;二级检测:轨道阱质量分析器,分辨率30K;二级扫描范围:m/z200-2000;最大离子注入时间:55ms。
8.根据权利要求1-7中任一项所述的方法,其特征在于,所述方法中还包括尿液样本特异性谱图库构建,所述谱图库涵盖一级母离子和二级碎片信息。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述尿液样本特异性谱图库构建的方法为:取10例疾病组的尿液样本进行等量混合,制成疾病组混合尿液样本;取10例健康组的尿液样本进行等量混合,制成健康组混合样本,将两个混合样本分别进行碱性条件下的反相预分级,分级成5个馏分,每个馏分分别采用数据依赖型质谱方法进行采集,同时未分级的混合样品也采用数据依赖型质谱方法进行4次重复采集;将采集得到的总共18个质谱数据搜库后用于构建谱图库。
10.根据权利要求1-9中任一项所述的方法,其特征在于,所述针对尿液样本的蛋白质组学质谱检测方法具体为:
(1)可变窗口的数据非依赖性质谱采集:
检测系统:纳流液相色谱-四极杆-静电场轨道阱-线性离子阱三合一高分辨质谱系统;
色谱条件:色谱柱为自制纳流C18色谱柱;上样量为1-5μL;流速为200-300nL/min;以含0.1%甲酸的水溶液为A流动相,以含0.1%甲酸的乙腈溶液为B流动相,分析梯度为:0-2min,3%-7%B流动相;2-52min,7%-22%B流动相;52-62min,22%-35%B流动相;62-64min,35%-90%B流动相;64-80min,90%B流动相;
质谱方条件:离子源为纳喷雾离子源,正离子模式;喷雾电压为1.8-2.2KV;离子传输管温度为280-350℃;
非依赖性质谱采集:
循环模式:一个一级全扫描+30个可变窗口的数据非依赖性二级扫描;
一级扫描模式:全扫描;一级扫描范围:m/z 350-1400;一级检测:轨道阱质量分析器,分辨率60K;选择模式:四级杆;30个可变窗口:m/z 349-374,m/z 374-393,m/z 393-408,m/z408-420,m/z 420-432,m/z 432-442,m/z 442-454,m/z 454-465,m/z 465-477,m/z 477-488,m/z 488-499,m/z 499-509,m/z 509-521,m/z 521-532,m/z 532-545,m/z 545-558,m/z 558-571,m/z 571-589,m/z 589-604,m/z 604-620,m/z 620-638,m/z 638-659,m/z659-679,m/z 679-701,m/z 701-730,m/z 730-768,m/z 768-810,m/z 810-857,m/z 857-947,m/z 947-1489;碎裂模式:高能碰撞解离,碎裂能量为30%;二级检测:轨道阱质量分析器,分辨率30K;二级扫描范围:m/z 200-2000;最大离子注入时间:55ms;
(2)尿液样本特异性谱图库构建
取10例疾病组的尿液样本进行等量混合,制成疾病组混合尿液样本;取10例健康组的尿液样本进行等量混合,制成健康组混合样本,将两个混合样本分别进行碱性条件下的反相预分级,分级成5个馏分,每个馏分分别采用数据依赖型质谱方法进行采集,同时未分级的混合样品也采用数据依赖型质谱方法进行4次重复采集;将采集得到的总共18个质谱数据搜库后用于构建谱图库,所述谱图库涵盖一级母离子和二级碎片信息;
(3)将构建的谱图库用于数据非依赖性质谱数据的谱图提取,以实现定性和定量分析。
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