[发明专利]检测环状RNA hsa_circ_0006148的引物、试剂盒和检测方法及其应用在审
申请号: | 201810188149.5 | 申请日: | 2018-03-07 |
公开(公告)号: | CN108277282A | 公开(公告)日: | 2018-07-13 |
发明(设计)人: | 范钰;吴朝晖;郎亚昆;陆上苏 | 申请(专利权)人: | 镇江市第一人民医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 | 代理人: | 董建林;薛海霞 |
地址: | 212002*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 环状RNA 引物 试剂盒 检测 胃癌 荧光定量PCR检测 逆转录反应体系 外周血样本 基因组DNA 疾病进展 早期诊断 治疗效果 外周血 预后 可用 应用 癌症 并用 | ||
1.检测环状RNA hsa_circ_0006148的引物,其特征在于,包括正向引物5’-TCTTAGACAGGCAGCGGAGG-3’;以及反向引物5’-AGAGGAGGAGACCGGAGATC-3’。
2.检测环状RNA hsa_circ_0006148的试剂盒,其特征在于,包括外周血样本的RNA提取试剂、权利要求1所述的检测环状RNA hsa_circ_0006148的引物、去基因组DNA反应体系及组成成分、逆转录反应体系及组成成分、qPCR反应体系及组成成分。
3.根据权利要求2所述的检测环状RNA hsa_circ_0006148的试剂盒,其特征在于,
去基因组DNA反应体系(总体积10 μL):5×g DNA 去除剂缓冲液,组分0.1 mM CaCl2缓冲液,2.0 μL;gDNA去除剂, 组分1 μg/μL DNase,2.0 μL;1μg/ μL总 RNA,2.0 μL;无RNA酶的dH2O,2.0 μL;
逆转录反应体系(总体积20 μL):去基因组DNA反应得到的反应液,其中RNA浓度为0.1μg/ μL,10.0 μL;200U/ μL逆转录酶,1.0 μL;RT引物,1.0 μL;5×缓冲液,成分为125mMMgCl2、12.5mM dNTPs,4.0 μL;无RNA酶的dH2O,4.0 μL;
qPCR反应体系(总体积20 μL):荧光定量PCR预混液,其中RNA酶1μg/ μL ,Taq酶0.5U/μL,10.0 μL;10 μM PCR正向引物,0.5 μL;10 μM PCR反向引物,0.5 μL;逆转录反应得到的cDNA,cDNA浓度为0.1μg/ μL,1.0 μL;DEPC水,8.0 μL。
4.根据权利要求2所述的检测环状RNA hsa_circ_0006148的试剂盒,其特征在于,去基因组DNA反应的条件为42℃ 2 min ;4℃ ∞;逆转录反应条件为:37℃ 15 min,85℃ 5s;4℃∞;
qPCR反应分为三个阶段:
阶段1:95℃,30S,1次循环;
阶段2:95℃,5S,40次循环; 60℃,31S,40次循环;
阶段3:95℃,15S,1次循环;60℃,60S,1次循环;95℃,15S,1次循环。
5.根据权利要求2所述的检测环状RNA hsa_circ_0006148的试剂盒,其特征在于,去基因组DNA反应体系采用含有1 μg/μL DNase 的0.1 mM CaCl2缓冲液;逆转录反应体系中采用含有200U/ μL逆转录酶的125mM MgCl2、12.5mM dNTPs缓冲液体系;RT引物为olige dT引物和随机六聚引物;qPCR反应体系中的荧光定量PCR预混液中,RNA酶1μg/ μL,Taq酶0.5U/μL。
6.检测环状RNA hsa_circ_0006148的方法,采用权利要求2-5任意一项所述的试剂盒,其特征在于,包括如下步骤:(1)获得待检外周血样本;(2)从待检外周血样本中提取RNA;(3)从提取的RNA中去除基因组DNA;(4)对于获得的RNA进行逆转录至cDNA;(5)对于获得的cDNA通过qPCR法进行检测。
7.根据权利要求6所述的检测环状RNA hsa_circ_0006148的方法,其特征在于,待检外周血样本来自于癌症病人及正常人,所述的癌症为胃癌。
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