[发明专利]一种基于二代测序的个体识别体系、试剂盒及其用途有效
申请号: | 201810189741.7 | 申请日: | 2018-03-08 |
公开(公告)号: | CN108517363B | 公开(公告)日: | 2022-02-22 |
发明(设计)人: | 李生斌;王泳钦;杨慧;龚雨晴 | 申请(专利权)人: | 深圳华大法医科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888 |
代理公司: | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人: | 廖金晖;彭家恩 |
地址: | 518083 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 二代 个体 识别 体系 试剂盒 及其 用途 | ||
1.一种基于二代测序的个体识别体系,其特征在于,包括针对112个STR位点和318个SNP位点同时扩增设计的引物序列,所述112个STR位点包括53个常染色体STR位点、23个X染色体STR位点及35个Y染色体STR位点和一个性别决定位点AMEL;所述318个SNP位点包括186个常染色体SNP位点、69个X染色体SNP位点、57个Y染色体SNP位点、及6个血型表型相关SNP位点;
所述53个常染色体STR位点对应的引物序列如SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.106所示;
所述性别决定位点AMEL和23个X染色体STR位点、35个Y染色体STR位点对应的引物序列如SEQ ID NO.107至SEQ ID NO.224所示;
所述186个常染色体SNP位点对应的引物序列如SEQ ID NO.225至SEQ ID NO.596所示;
所述69个X染色体SNP位点对应的引物序列如SEQ ID NO.597至SEQ ID NO.734所示;
所述57个Y染色体SNP位点对应的引物序列如SEQ ID NO.735至SEQ ID NO.848所示;
所述6个血型表型相关SNP位点对应的引物序列如SEQ ID NO.849至SEQ ID NO.860所示。
2.一种DNA分型检测的方法,其特征在于,采用权利要求1所述的个体识别体系分型检测DNA。
3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,所述112个STR位点和318个SNP位点在同一个PCR扩增反应体系中同时扩增或者分开扩增。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增反应体系包括15ul的DNA聚合酶、5ul的引物混合物、1ul的DNA模板和4ul的去离子水。
5.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增反应体系的温度循环包括四次循环,其中第一循环为在温度为95℃时间为5min条件下的1个循环;第二循环包括三个阶段的30个循环,所述三个阶段包括在温度为94℃时间为30s条件下的第一阶段、在温度为56℃时间为90s条件下的第二阶段、以及在温度为72℃时间为30s条件下的第三阶段;第三循环为在温度为72℃时间为10min条件下的1个循环;第四循环为在温度为4℃时间不限条件下的1个循环。
6.一种试剂盒,其特征在于,包括引物混合物,所述引物混合物包括权利要求1所述的引物序列。
7.如权利要求6所述的试剂盒,还包括缓冲液、DNA聚合酶、DNA模板和去离子水;
所述DNA模板来源包括血液、血斑、血浆、毛囊和口腔拭子。
8.如权利要求7所述的试剂盒在个体身份识别、亲缘关系鉴定、母血分型、混合复杂样本分型、二代DNA档案建立、血型鉴定及芯片生产中的应用。
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