[发明专利]一种精准挖掘大豆耐涝基因的方法

权利要求书

1.一种精准挖掘大豆耐涝基因的方法，其特征在于：包括以下步骤：

1)大豆耐涝基因的QTL定位：以耐涝性强的大豆品种齐黄34和耐涝性差的大豆品种冀豆17作为亲本，配杂交组合，构建RIL群体，对F2:5群体256个家系进行简化基因组测序，进而对这两个亲本进行全基因组重测序；对256个家系进行耐涝性鉴定，以没顶淹没的方法，统计相对死苗率作为评价指标，进行统计记录；结合基因组和表型鉴定结果，进行大豆耐涝相关基因的QTL定位；

2)转录组测序：以耐涝性较好的大豆品种齐黄34作为试验材料，进行没顶淹没处理，取大豆根部组织作为测序的材料，设置不同的取样时间点，送样进行转录组测序；

3)蛋白组测序：淹水24h取大豆根部组织，进行蛋白组测序；

4)对上述结果进行数据分析：

a.根据亲本重测序结果、256个家系的F2:5RIL群体的简化基因组测序结果和表型鉴定的数据，定位大豆耐涝相关的QTL；

b.通过转录组数据，筛选出4个时间点交集的差异表达基因，进行GO和KEGG分析，筛选出Pvalue值小于0.05的GO和基因通路；

c.针对淹水24h这个时间点，结合转录组和蛋白组的数据，筛选在两个组学中都呈现差异表达的基因和蛋白；根据GO和KEGG分析，筛选出Pvalue值小于0.05的GO和基因通路；

d.将b与c的结果进行关联分析，进一步筛选交集的GO、基因通路及差异表达基因；e.最终结合a和d，更有针对性地挖掘大豆耐涝基因。

2.根据权利要求1所述的一种精准挖掘大豆耐涝基因的方法，其特征在于：步骤2)中，所述取样时间点分别设为淹水3、6、12和24h。