[发明专利]一种检测败血症病原体的方法有效
申请号: | 201810204482.0 | 申请日: | 2018-03-13 |
公开(公告)号: | CN110273012B | 公开(公告)日: | 2022-11-04 |
发明(设计)人: | 牛建军;李庆阁;廖逸群;许晔;林素 | 申请(专利权)人: | 厦门大学 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6895;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 中国贸促会专利商标事务所有限公司 11038 | 代理人: | 林远成 |
地址: | 361005 福建*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 败血症 病原体 方法 | ||
1.一种探针组,其包含一种检测探针,以及至少两种的媒介子探针,其中,
所述媒介子探针各自独立地从5'至3'方向包含媒介子序列和靶特异性序列,所述靶特异性序列包含与特异于一种败血症病原体的一种靶核酸序列或一种对照序列互补的序列,所述媒介子序列包含不与所述靶核酸序列或对照序列互补的序列,并且,所有媒介子探针所包含的媒介子序列彼此不同;和
所述检测探针从3'至5'方向包含,与每一种媒介子序列或其部分互补的捕获序列,以及模板序列;并且,所述检测探针标记有报告基团和淬灭基团,其中,所述报告基团能够发出信号,并且,所述淬灭基团能够吸收或淬灭所述报告基团发出的信号;并且,所述检测探针在与其互补序列杂交的情况下发出的信号不同于在未与其互补序列杂交的情况下发出的信号。
2.权利要求1的探针组,其中,所述探针组具有选自下列的一个或多个特征:
(1)所述探针组包含2种、3种、4种、5种、6种、7种、8种、9种、10种或更多种媒介子探针;
(2)所有媒介子探针所包含的媒介子序列彼此不同;并且,所有媒介子探针所包含的靶特异性序列彼此不同;
(3)所有媒介子探针各自靶向不同的靶核酸序列;
(4)至少一条媒介子探针或其所包含的靶特异性序列靶向对照序列;
(5)所述探针组还包含上游寡核苷酸序列,所述上游寡核苷酸序列包含与所述靶核酸序列互补的序列;并且,当与所述靶核酸序列杂交时,所述上游寡核苷酸序列位于所述媒介子探针的靶特异性序列的上游;
(6)所述探针组还包含下游寡核苷酸序列,所述下游寡核苷酸序列包含与所述靶核酸序列互补的序列;并且,当与所述靶核酸序列杂交时,所述下游寡核苷酸序列位于所述媒介子探针的靶特异性序列的下游。
3.权利要求2的探针组,其中,所述媒介子探针或其所包含的靶特异性序列靶向2种、3种、4种、5种、6种、7种、8种、9种、10种或更多种败血症病原体的特异性核酸序列。
4.权利要求2的探针组,其中,所述不同的靶核酸序列各自特异于相同或不同的败血症病原体。
5.权利要求2的探针组,其中,所述对照序列为宿主特异性序列。
6.权利要求5的探针组,其中,所述宿主特异性序列为人特异性序列。
7.权利要求1的探针组,其中,每一种败血症病原体各自独立地选自,克柔念珠菌、酿脓链球菌、产酸克雷伯菌、白色念珠菌、肺炎克雷伯菌、柠檬酸杆菌、鲍曼不动杆菌、表皮葡萄球菌、无乳链球菌、粪肠球菌、头状葡萄球菌、屎肠球菌、流感嗜血杆菌、奇异变形杆菌、阴沟肠杆菌、烟曲霉菌、溶血性葡萄球菌、铜绿假单胞菌、近平滑念珠菌、变异链球菌、粘质沙雷氏菌、单增李斯特菌、肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、光滑念珠菌、产气肠杆菌、停乳链球菌、咽峡炎链球菌,或其任何组合。
8.权利要求1的探针组,其中,至少一种败血症病原体选自克柔念珠菌、产酸克雷伯菌、柠檬酸杆菌、无乳链球菌、头状葡萄球菌、近平滑念珠菌、变异链球菌、粘质沙雷氏菌、单增李斯特菌、光滑念珠菌、产气肠杆菌、停乳链球菌、咽峡炎链球菌、人葡萄球菌、路登葡萄球菌、洋葱伯克霍尔德氏菌、嗜水气单胞菌、鼠伤寒沙门氏菌、缓症链球菌、中间型链球菌、星座链球菌、脑膜炎奈瑟菌、产气芽孢杆菌、热带念珠菌和副流感嗜血杆菌。
9.权利要求1的探针组,其中,至少一种败血症病原体选自克柔念珠菌、产酸克雷伯菌、柠檬酸杆菌、无乳链球菌、头状葡萄球菌、近平滑念珠菌、变异链球菌、粘质沙雷氏菌、单增李斯特菌、光滑念珠菌、产气肠杆菌、停乳链球菌和咽峡炎链球菌。
10.权利要求2的探针组,其中,针对每一种靶核酸序列和媒介子探针,提供一种上游寡核苷酸序列。
11.权利要求2的探针组,其中,针对每一种靶核酸序列和媒介子探针,提供一种下游寡核苷酸序列。
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