[发明专利]一种优质高产三七的鉴定方法在审
申请号: | 201810224481.2 | 申请日: | 2018-03-19 |
公开(公告)号: | CN108277262A | 公开(公告)日: | 2018-07-13 |
发明(设计)人: | 郑云;李世鹏;廖沛然;崔秀明 | 申请(专利权)人: | 昆明理工大学 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 650093 云*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 三七根 高产 实时荧光PCR 第一链 合成 实时荧光定量PCR 荧光定量PCR检测 荧光定量PCR 待检测样品 特异性引物 总RNA提取 检测结果 快速鉴定 实验鉴定 相对定量 植株 靶基因 试剂盒 解析 | ||
1.一种优质高产三七的鉴定方法,包括如下步骤:
(1)待检测三七根样品总RNA提取;
(2)将待检测样品总RNA中的miRNA反转录成cDNA,并合成第一链,用于miRNA实时荧光PCR分析;
(3)将待检测样品RNA反转录成cDNA第一链,用于靶基因实时荧光PCR分析;
(4)以RNA cDNA第一链和miRNA cDNA第一链为模板,用特异性引物和试剂盒进行荧光定量PCR检测;以PnACT2为三七的内参基因,是SPL5的对照组;以5.8S ribosomal RNA为miR156g-5p的对照组;
(5)根据实时荧光定量PCR检测结果进行判断;
其特征在于,步骤(2)中所述miRNA为miR156g-5p,步骤(3)中所述RNA为SPL5,步骤(4)中所述特异性引物如下表所示:
。
2.根据权利要求1所述的鉴定方法,其特征在于,步骤(4)中,
对miRNA cDNA第一链的RT-qPCR反应条件为:
a、94℃2min,1个循环,起始模板变性;
b、94℃20s,35-45个循环,PCR循环中模板变性;
c、60℃34s,35-45个循环,退火,延伸。
对RNA cDNA第一链的RT-qPCR反应条件为:
a、95℃2min,1个循环,起始模板变性;
b、95℃15s,60℃1min,40个循环,PCR扩增。
3.根据权利要求1所述的鉴定方法,其特征在于,步骤(5)中采用相对定量解析方法即2-△△Ct法(△△Ct=(Ct目标基因-Ct内参基因)-(Ct对照基因-Ct内参基因))计算目标基因在样品中的相对表达水平。
4.根据权利要求3所述的鉴定方法,其特征在于,步骤(5)中判断优质高产三七的方法是:
(1)miR156g-5p的实时荧光PCR结果即:2-△△Ct高于6.396,
或
(2)靶基因SPL5的实时荧光PCR结果即:2-△△Ct低于0.046,
则待检测样品为优质高产三七植株。
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