[发明专利]一种鼻咽癌患病风险检测试剂盒有效
申请号: | 201810286877.X | 申请日: | 2018-04-03 |
公开(公告)号: | CN108504735B | 公开(公告)日: | 2021-07-23 |
发明(设计)人: | 何志巍;黄国良;彭述堂;曾柳燕;许南松 | 申请(专利权)人: | 广东医科大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 北京汇彩知识产权代理有限公司 11563 | 代理人: | 彭逊 |
地址: | 523000 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鼻咽癌 患病 风险 检测 试剂盒 | ||
本发明提供了一种鼻咽癌患病风险检测试剂盒,用于检测人ATF1rs11169571位点T/C突变,所述试剂盒包括:蛋白酶K、缓冲液GB、缓冲液GD、漂洗液PW、超纯水、ATF1上游引物,ATF1下游引物,Go Taq Green Master Mix 2x,RNase Free H2O,Hind III酶,buffer10x,TBE缓冲液,琼脂糖,溴化乙锭,溴酚蓝指示剂;所述ATF1上游引物为5’‑CGCACGATATCTAGTGACAGAGG‑3’,所述ATF1下游引物为5’‑TGCAAACCTGTAGGGTAAATGG‑3’。
技术领域
本发明涉及生物技术检测领域,具体涉及一种鼻咽癌患病风险检测试剂盒及人ATF1 rs11169571单核苷酸多态性的测试方法。
背景技术
鼻咽癌(NPC)是我国南方常见的恶性肿瘤,广东为高发区。鼻咽癌是指鼻咽粘膜上皮发生的癌肿,大多为低分化鳞癌,其恶性度高,发病部位隐蔽,特别是在咽隐窝和鼻咽顶部者,早期症状不明显,因而难以早期发现,误诊误治率较高,可达12.2%,因而在确诊的鼻咽癌中,其5年生存率长期徘徊在50%~60%左右。对鼻咽癌进行早期诊断以便早期治疗,提高患者的生存率一直是NPC临床研究的重要课题之一。
目前对鼻咽癌早期的检测方法有多种,包括有:EB病毒血清学标记物如病毒壳抗原一免疫球蛋白、EB病毒潜伏膜蛋白、EB病毒早期复合抗原的抗体检测,鼻咽癌相关肿瘤标记物如白细胞介素、肿瘤坏死因子、细胞间黏附分子、CYFRA 2121以及端粒酶等的检测。虽然这些指标的单独或联合应用为鼻咽癌的诊断提供了有用的信息,然而它们均缺乏足够的灵敏度与特异性。建立一种能对鼻咽癌患者进行筛查、诊断的无创性检测方法,对鼻咽癌的早期筛查、诊断、预防及治疗等具有重要意义。
发明内容
本发明公开了一种鼻咽癌患病风险检测试剂盒及人ATF1rs11169571单核苷酸多态性的测试方法,通过使用本发明的检测试剂盒,实现了对人ATF1 rs11169571单核苷酸多态性的检测,根据所得的人ATF1 rs11169571位点T/C突变结果作为鼻咽癌患病风险的评价指标。
本发明的第一方面公开了一种鼻咽癌患病风险检测试剂盒,用于检测人ATF1rs11169571位点T/C突变,所述试剂盒包括:蛋白酶K、缓冲液GB、缓冲液GD、漂洗液PW、超纯水、ATF1上游引物,ATF1下游引物,Go Taq Green Master Mix 2x,RNase Free H2O,HindIII酶,buffer 10x,TBE缓冲液,琼脂糖,溴化乙锭,溴酚蓝指示剂;所述ATF1上游引物为5’-CGCACGATATCTAGTGACAGAGG-3’,所述ATF1下游引物为5’-TGCAAACCTGTAGGGTAAATGG-3’。
本发明的第二方面公开了一种人ATF1rs11169571单核苷酸多态性的测试方法,其特征在于使用权利要求1所述的鼻咽癌患病风险检测试剂盒,包括以下步骤:
(1)血液基因组DNA的提取;
(2)将步骤1提取的DNA,ATF1上游引物,ATF1下游引物,Go Taq Green Master Mix2x,RNase Free H2O加入PCR管中,在PCR仪中进行PCR反应;
(3)将步骤2得到的PCR产物,RNase Free H2O,Hind III酶,buffer 10x进行酶切实验;
(4)通过水平式琼脂糖凝胶电泳法检测步骤3中的酶切产物;
(5)采用卡方检验,Logistics回归分析对步骤4的实验结果进行分析。
进一步地,所述步骤2中PCR仪的反应条件为:依次95℃5min,95℃40s,58℃40s,72℃40s,72℃5min进行45个循环。
发明的有益效果
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