[发明专利]一种基于19F-NMR技术快速检测利奥西呱与蛋白相互作用的方法在审
申请号: | 201810300832.3 | 申请日: | 2018-04-04 |
公开(公告)号: | CN108303440A | 公开(公告)日: | 2018-07-20 |
发明(设计)人: | 邢杰;马睿;王姝麒 | 申请(专利权)人: | 山东大学 |
主分类号: | G01N24/08 | 分类号: | G01N24/08 |
代理公司: | 济南金迪知识产权代理有限公司 37219 | 代理人: | 陈桂玲 |
地址: | 250012 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 蛋白相互作用 可用 快速检测 蛋白 人血清白蛋白 结合位点数 亲水性溶剂 蛋白结构 蛋白作用 化学位移 结合位点 竞争试剂 曲线拟合 数量关系 信号响应 溶剂比 溶解度 学位移 检测 位点 优化 研究 | ||
1.一种基于19F-NMR技术快速检测化合物与蛋白相互作用的方法,包括步骤:
1)将氘代DMSO重水按体积比1:2混合,以该溶剂溶解利奥西呱;配制利奥西呱-人血清蛋白摩尔浓度比为1:0,1:0.02,1:0.11,1:0.44,1:0.66,1:1,1:1.33,1:2,1:3的混合溶液,以三氟乙酸定标,检测混合体系19F-NMR谱,调节NMR参数;记录化学位移,利用以下公式计算结合常数和结合位点数:
其中δt是实测化学位移,δc是游离配体化合物化学位移,δb是结合态化合物位移,K为结合常数,F是化合物浓度,B是蛋白浓度,n为结合位点数量;
2)利用华法林和布洛芬为位点竞争试剂判断利奥西呱结合位点,配制摩尔浓度比为1:1的利奥西呱-人血清蛋白溶液,以三氟乙酸定标,在该复合溶液中加入华法林溶液作为位点1竞争试剂,该复合溶液中加入布洛芬溶液作为位点2竞争试剂,检测其结合位点。
2.如权利要求1所述的基于19F-NMR技术快速检测化合物与蛋白相互作用的方法,其特征在于,步骤1)所述的调节NMR参数为:脉冲程序调至zgf1qn,扫场次数调至8219,采样点数调至131072,空扫次数调至4,谱宽调至89285.711Hz,采样时间调至0.7340032sec,增益调至210.38,弛豫时间调至1.00000000sec,脉宽调至17.9usec。
3.如权利要求1所述的基于19F-NMR技术快速检测化合物与蛋白相互作用的方法,其特征在于,步骤1)所述的DMSO在整个体系中的体积含量控制在5%以下。
4.如权利要求1所述的基于19F-NMR技术快速检测化合物与蛋白相互作用的方法,其特征在于,步骤1)优化了数据处理方式,所述公式中仅δt,F和B三个已知变量,其余δc,δb和n为未知参数,利用matlab数据处理软件拟合出浓度与化学位移相关曲线,调节运算初始值,及其上下限范围,即设置初始估值分别为:K,5000,上下限为1000000和100;δb为-42,上下限为100和-100;n初始值为1,上下限为10和0。
5.如权利要求1所述的基于19F-NMR技术快速检测化合物与蛋白相互作用的方法,其特征在于,具体步骤如下:
1)配制0.01M pH 7.4PBS溶液,以该溶液溶解浓度依次为6,4,2.67,2,1.32,0.66,0.22,0.04mM的人血清白蛋白各600μL;
2)将氘代DMSO重水按体积比1:2混合,以该溶剂溶解利奥西呱,使利奥西呱终浓度为80mM;
3)将80mM浓度利奥西呱精密取40μL加入不同浓度血清蛋白溶液中,使利奥西呱终浓度为2mM,另外在PBS中加入相同体积上述溶液配制为只有利奥西呱的对照溶液,配制成配体蛋白摩尔浓度比为1:0,1:0.02,1:0.11,1:0.44,1:0.66,1:1,1:1.33,1:2,1:3混合溶液;
4)将步骤3)制备的蛋白利奥西呱混合溶液涡旋混匀,于室温下孵育60min,转移至核磁管中,送入核磁谱仪检测,调整NMR参数:脉冲程序调至zgf1qn,扫场次数调至8219,采样点数调至131072,空扫次数调至4,谱宽调至89285.711Hz,采样时间调至0.7340032sec,增益调至210.38,弛豫时间调至1.00000000sec,脉宽调至17.9usec;
5)图谱检测完成后,进行傅里叶变换,调整相位,对图谱定标,将-75.58ppm左右的三氟乙酸定位为0ppm,得出未加蛋白时利奥西呱化学位移为-43.03ppm,加入蛋白的利奥西呱向低场位移,说明氟原子与蛋白发生相互作用;
6)根据利奥西呱化学位移和一下公式计算结合常数和结合位点数:
其中δt是实测化学位移,δc是游离配体化合物化学位移,δb是结合态化合物位移,K为结合常数,F是化合物浓度,B是蛋白浓度,n为结合位点数量;根据以上公式用matlab拟合曲线,利用fitting tool中的custom equation自定义公式,设置初始估值分别为:K,5000,上下限为1000000和100;δb为-42,上下限为100和-100;n初始值为1,上下限为10和0;
7)在摩尔浓度比为1:1的利奥西呱-人血清白蛋白混合溶液中加入不同浓度华法林和布洛芬,送入核磁谱仪检测,进行傅里叶变换,调整相位,以三氟乙酸定标,得到人血清白蛋白使利奥西呱的信号消失,华法林的加入使利奥西呱信号重新出现,故利奥西呱与华法林结合物位点一致。
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