[发明专利]官庄花猪SNP位点、SNP芯片与其检测引物组合、检测试剂盒及其应用和种质鉴定方法

说明书

本发明提供了官庄花猪SNP位点及其建立方法与应用，属于动物分子生物技术及动物遗传育种领域。本发明提供官庄花猪SNP位点，具有明显的官庄花猪的种属特异性，实用性较强，具备较好开发和应用前景，将官庄花猪SNP位点及检测该SNP位点的检测引物应用于制备SNP芯片或检测试剂盒，并将SNP芯片或检测试剂盒应用官庄花猪种质鉴定中，具有较好的检测结果，为种质鉴定提供较好的数据支撑，具有较好的社会价值和实际推广应用值。

技术领域

本发明涉及动物分子生物技术及动物遗传育种领域，具体而言，涉及官庄花猪SNP位点、SNP芯片与其检测引物组合、检测试剂盒及其应用和种质鉴定方法。

背景技术

我国国土幅员辽阔，地大物博，也是世界上养猪最早的国家之一，历史达几千年之久，猪在中国被誉为六畜之首。由于自然环境、经济条件和民俗文化的影响，我国拥有着丰富的、各具特色的地方猪种资源，是世界猪种基因库中的宝贵资源。

官庄花猪官庄花猪是福建省八大地方优良猪种之一，该地方猪种适应性强，性情温顺，耐粗易养，抗病力强，脂肪沉积早，脂肪雪白如白玉，肌纤维细，肉质细嫩，肉色暗红，大理石纹丰富，系水力强，弹性良好。官庄花猪母性好，繁殖性能强，抗病力强，饲养粗放。该猪种的皮较厚，仔猪适合做“烤乳猪”。

然而目前针对官庄花猪的研究还不多见，尤其是分子以及单核苷酸多态性方面的研究还有待提高；目前，还没针对官庄花猪的种质特征方面的研究还有待深入。

发明内容

本发明的第一目的在于提供官庄花猪SNP位点，该官庄花猪SNP位点，具有明显的官庄花猪种属特异性，实用性较强，具备较好开发和应用前景。

本发明的第二目的在于提供上述的官庄花猪SNP位点在上杭花猪种质鉴定中的应用。

本发明的第三目的在于提供一种官庄花猪种质的鉴定方法，本方法通过鉴定上述的SNP位点，实现快速鉴定官庄花猪，为种质鉴定和生产鉴定提供可靠依据。

本发明的第四目的在于提供一种用于猪品种鉴定的SNP芯片，该SNP芯片用于鉴定和分析官庄花猪的SNP位点，方便快捷。

本发明的第五目的在于提供上述的SNP芯片在官庄花猪种质鉴定中的应用。

本发明的第六目的在于提供检测上述的官庄花猪SNP位点的检测引物组合。

本发明的第七目的在于提供上述的官庄花猪SNP位点的检测引物组合在官庄花猪种质鉴定中的应用。

本发明的第八目的在于提供一种官庄花猪SNP位点检测的检测试剂盒。

为了实现本发明的上述目的，采用以下技术方案：

官庄花猪SNP位点，官庄花猪SNP位点包括：

(1)MARC0110659，SNP位点基因型：AA；

(2)H3GA0003731，SNP位点基因型：GG；

(3)DRGA0002305，SNP位点基因型：AA；

(4)ASGA0009835，SNP位点基因型：GG；

(5)MARC0113860，SNP位点基因型：TT；

(6)ASGA0020113，SNP位点基因型：AA；

(7)ALGA0028821，SNP位点基因型：TT；

(8)DRGA0005669，SNP位点基因型：GG；

(9)DRGA0005851，SNP位点基因型：AA；

(10)MARC0021061，SNP位点基因型：TT；