[发明专利]一种影响杜洛克猪眼肌面积性状的分子标记及应用

说明书

本发明属于分子标记辅助选择技术及动物遗传育种领域，公开了一种影响猪眼肌面积的SNP分子标记及其应用。所述SNP分子标记为猪基因组第6号染色体第35091111位碱基由A到G的位点突变，对应于SEQ ID NO:1所示序列中的第214bp处(命名为：g.214 T>G)。利用本发明的引物对，以猪基因组DNA为模板进行PCR扩增，可以得到与猪眼肌面积性状紧密连锁的SNP分子标记。本发明提供的分子遗传标记可以用于种猪的眼肌面积的筛选，能够有效提高猪的眼肌面积及肉质性状。

技术领域

本发明属于分子标记辅助选择技术及动物遗传育种领域，特别涉及一种影响眼肌面积性状的分子标记及其应用。

背景技术

我国是世界上猪肉生产和猪肉消费的第一大国。近些年来，随着猪肉总量和人民生活水平的提高，人民对高品质的猪肉需求越来越高。眼肌也叫背最长肌，是猪全身最鲜嫩的肉，营养丰富，味美，易消化。眼肌就是高品质猪肉的代表。因此提高高品质猪肉产量成为新的育种目标，而眼肌面积作为影响猪肉品质的主要因素，成为猪育种计划的一部分。

目前，利用基因组扫描法和候选基因法已经发现了与猪的眼肌面积性状显著相关的322个QTLs，分布在所有的染色体上。但是这两种方法还是有着自身无法克服的缺陷。QTL连锁分析的一致性检验会受到不同资源家系群体的影响，而且一个QTL的区域很大，往往包括上百个候选基因，要做到精细定位QTL同时找到更多的相邻连锁标记也比较困难，而在基因定位中，由于现用定位材料的局限性，常常存在定位不准确的问题，而且在数量性状基因座QTL定位的技术中，并不是所有的目标QTL都可以被检测出来，且QTL与环境存在互作、以及大效应的QTL对小效应的QTL的掩盖等问题。候选基因法必须选择功能已知的候选基因作为目标基因，基本不能鉴别出新的基因。GWAS是目前为止鉴定SNPs、候选基因或候选基因家族的一种更为有效的方法。眼肌面积性状与产肉性能有强相关关系，眼肌面积越大，饲料利用率与瘦肉率也越高。对于眼肌面积的选择可以促进其他的经济性状的提升。

杜洛克(Duroc)是世界上著名的瘦肉型猪种之一。其具备生长快，饲料转化率高，胴体瘦肉率高，肌内脂肪含量较高，抗逆性强的特点。国内商品猪生产已建立起较为成熟的杂交配套体系。其中杜长大的杂交组合在我国的内销和外销市场中持续保持绝对的优势地位。

发明内容

为克服上述现有技术中存在的缺点与不足，本发明的首要目的是提供一种影响眼肌面积性状的SNP分子标记及其用途，以实现猪眼肌性状的遗传改良。

本发明的上述目的通过以下技术手段实现：

一方面，本发明提供了一种影响眼肌面积性状的SNP分子标记，所述的分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，其中序列中的M是T或G，该分子标记的SNP位点为SEQ IDNO:1序列片段标注位置g.214T>G，其差异导致眼肌面积的不同。所述分子标记的SNP位点对应于国际猪参考基因组11.1版本6号染色体上第35091111bp处的T>G突变。

另一方面，本发明还提供一种用于检测上述分子标记的引物对，所述引物对的核酸序列如下所示：

上游引物如SEQ ID NO:2所示；

下游引物如SEQ ID NO:3所示。

另一方面，本发明还提供上述的分子标记、引物对、试剂盒在研究/鉴定/检测/调节的猪眼肌面积性状，或者是猪繁殖育种中的应用。进一步地，所述的繁殖育种优选为分子标记辅助选择。

另一方面，本发明还提供了一种鉴定眼肌面积性状的方法，其包含如下步骤：检测SEQ ID NO:1序列的5’端第214bp是T还是G(即SEQ ID NO:1序列中的M标记处是T还是G)。该方法可以在猪生长早期对眼肌面积性状进行鉴定，

作为优选的实施方式，采用上述的引物对进行检测。