[发明专利]一种与谷子株高性状相关的SNP标记及其检测引物和应用有效
申请号: | 201810339797.6 | 申请日: | 2018-04-16 |
公开(公告)号: | CN108715901B | 公开(公告)日: | 2022-03-29 |
发明(设计)人: | 赵治海;史高雷;魏玮;宋国亮;张耕耘;张晓磊;赵芳;李欣儒;王晓明 | 申请(专利权)人: | 张家口市农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人: | 李小焦;彭家恩 |
地址: | 075032 河北省张家口市*** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 谷子 性状 相关 snp 标记 及其 检测 引物 应用 | ||
1.一种SNP标记在谷子株高预测、谷子株高性状早期鉴定或谷子株高性状方面的分子辅助筛选育种中的应用,其特征在于:所述SNP标记的序列如Seq ID No.1所示,该序列自5’端起第163位碱基为C或T;所述SNP标记位于第四条染色体第18023413bp至第21734440bp的bin标记内,且与谷子株高紧密连锁。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:对SNP标记,利用复合区间作图法,采用5%的总体显著水平,QTL检测的LOD值为3.2792,表型变异解释率为2.76%。
3.一种预测谷子株高的方法,其特征在于:包括采用引物对,对预测对象的谷子基因组DNA进行PCR扩增,通过PCR扩增产物的测序结果,获得权利要求1或2中所述的SNP标记的碱基情况,根据所述SNP标记的碱基情况预测谷子的株高;
所述引物对的上游引物为Seq ID No.2所示序列,下游引物为Seq ID No.3所示序列;
Seq ID No.2:5’-AAACGAGCAACGGGTAGGC-3’
Seq ID No.3:5’-GGAAAGACAGCAGGAACAGAG-3’。
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