[发明专利]一种基于苹果转录因子ERF4第225位的氨基酸残基种类预测苹果果实硬度的方法

权利要求书

1.一种预测待测苹果果实硬度的方法，包括如下步骤：检测待测苹果的苹果转录因子ERF4自N末端起第225位的氨基酸残基种类；

“苹果转录因子ERF4自N末端起第225位的氨基酸残基种类仅为脯氨酸残基”的待测苹果的果实硬度高于“苹果转录因子ERF4自N末端起第225位的氨基酸残基种类为脯氨酸残基和丙氨酸残基”的待测苹果；

所述苹果转录因子ERF4自N端至C端依次由区段Ⅰ、区段Ⅱ和区段Ⅲ组成；

所述区段Ⅰ为氨基酸序列是序列表中序列3自N末端起第1至224位所示的多肽；

所述区段Ⅱ为脯氨酸残基或丙氨酸残基；

所述区段Ⅲ自N端至C端依次为PSEV；

所述待测苹果为红富士、紫塞明珠和/或红富士和紫塞明珠的杂交后代。

2.一种预测待测苹果果实硬度的方法，包括如下步骤：检测待测苹果总RNA的特定转录本中第225个密码子的核苷酸序列；所述特定转录本为苹果转录因子ERF4的编码基因转录得到的RNA，其第1个密码子为起始密码子；

“特定转录本中第225个密码子的核苷酸序列仅编码脯氨酸”的待测苹果的果实硬度高于“特定转录本中第225个密码子的核苷酸序列编码脯氨酸和丙氨酸”的待测苹果；

所述苹果转录因子ERF4自N端至C端依次由区段Ⅰ、区段Ⅱ和区段Ⅲ组成；

所述区段Ⅰ为氨基酸序列是序列表中序列3自N末端起第1至224位所示的多肽；

所述区段Ⅱ为脯氨酸残基或丙氨酸残基；

所述区段Ⅲ自N端至C端依次为PSEV；

所述待测苹果为红富士、紫塞明珠和/或红富士和紫塞明珠的杂交后代。

3.一种预测待测苹果果实硬度的方法，包括如下步骤：检测待测苹果总DNA中苹果转录因子ERF4的编码基因自5’末端起第673位的核苷酸种类；

“苹果转录因子ERF4的编码基因自5’末端起第673位的核苷酸种类仅为C”的待测苹果的果实硬度高于“苹果转录因子ERF4的编码基因自5’末端起第673位的核苷酸种类为C和G”的待测苹果；

所述苹果转录因子ERF4的编码基因为如下x1）或x2）：

x1）其核苷酸序列是序列表中序列1所示的DNA分子；

x2）其核苷酸序列是序列表中序列2所示的DNA分子；

所述待测苹果为红富士、紫塞明珠和/或红富士和紫塞明珠的杂交后代。

4.一种预测待测苹果果实硬度的方法，包括如下步骤：提取待测苹果的总RNA并反转录为cDNA，然后采用特异引物对进行PCR扩增，检测PCR扩增产物；

“PCR扩增产物中具有序列表的序列1所示的DNA分子且不具有序列表的序列2所示的DNA分子”的待测苹果的果实硬度高于“PCR扩增产物中具有序列表的序列1所示的DNA分子且具有序列表的序列2所示的DNA分子”的待测苹果；

所述特异引物对由用于扩增特异DNA片段的两条引物组成；所述特异DNA片段中具有苹果基因组中引物F1和引物R1组成的引物对的靶序列；

所述引物F1为序列表的序列5所示的单链DNA分子；

所述引物R1为序列表的序列6所示的单链DNA分子；

所述待测苹果为红富士、紫塞明珠和/或红富士和紫塞明珠的杂交后代。

5.一种预测待测苹果果实硬度的方法，包括如下步骤：检测待测苹果总DNA中是否具有序列表的序列1所示的DNA分子和序列表的序列2所示的DNA分子；

“待测苹果总DNA中具有序列表的序列1所示的DNA分子且不具有序列表的序列2所示的DNA分子”的待测苹果的果实硬度高于“待测苹果总DNA中具有序列表的序列1所示的DNA分子且具有序列表的序列2所示的DNA分子”的待测苹果；

所述待测苹果为红富士、紫塞明珠和/或红富士和紫塞明珠的杂交后代。

6.权利要求1至5任一所述的方法，其特征在于：所述果实硬度为果皮硬度和/或果肉硬度。