[发明专利]一种基于核磁共振CPMG衰减曲线鉴别玉米单倍体籽粒的方法有效
| 申请号： | 201810377928.X | 申请日： | 2018-04-25 |
| 公开（公告）号： | CN108445035B | 公开（公告）日： | 2021-02-02 |
| 发明（设计）人： | 陈绍江;李金龙;李伟;焦炎炎;张俊稳;陈琛;陈明;刘晨旭;田小龙;钟裕;祁晓龙;王鼎昌 | 申请（专利权）人： | 中国农业大学 |
| 主分类号： | G01N24/08 | 分类号： | G01N24/08 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人： | 关畅;何叶喧 |
| 地址： | 100193 *** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 基于 核磁共振 cpmg 衰减 曲线 鉴别 玉米 单倍体 籽粒 方法 | ||
【权利要求书】：
1.一种鉴别玉米单倍体的方法，包括如下步骤：
(1)采集训练集各个玉米籽粒的核磁信号，获得每个籽粒的CPMG衰减曲线，然后用每个时间点对应的振幅除以籽粒重量以归一化数据，获得每个籽粒质量归一化后的CPMG衰减曲线；训练集由若干玉米籽粒组成，其中一部分为真实单倍体，另一部分为真实二倍体；
(2)对步骤(1)获得的质量归一化后的CPMG衰减曲线的0-600ms区段进行数据处理，然后进行主成分分析，然后构建单倍体鉴别模型；构建单倍体鉴别模型的算法为支持向量机算法；支持向量机算法的参数为：sigma＝0.004976874，惩罚系数C＝16；
(3)取待测玉米籽粒，采集核磁信号，获得CPMG衰减曲线，然后用每个时间点对应的振幅除以籽粒重量以归一化数据，获得质量归一化后的CPMG衰减曲线；
(4)对步骤(3)获得的质量归一化后的CPMG衰减曲线的0-600ms区段进行数据处理，然后进行主成分分析，然后将结果代入步骤(2)构建的单倍体鉴别模型，由模型输出该待测玉米籽粒为预测单倍体或者预测二倍体的结果；
所述步骤(2)和所述步骤(4)中，所述数据处理为10点平滑处理；
所述步骤(2)和所述步骤(4)中，所述主成分分析的主成分数量为100；
所述步骤(2)和所述步骤(4)中，所述主成分分析为基于R语言的主成分分析。
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