[发明专利]一种DNA检测的方法、装置及终端设备在审
申请号: | 201810380856.4 | 申请日: | 2018-04-25 |
公开(公告)号: | CN108664765A | 公开(公告)日: | 2018-10-16 |
发明(设计)人: | 周海鹏;熊峰;韩珂珩 | 申请(专利权)人: | 深圳劲宇生物科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/22 | 分类号: | G06F19/22 |
代理公司: | 深圳中一联合知识产权代理有限公司 44414 | 代理人: | 张全文 |
地址: | 518000 广东省深圳市坪山新区*** | 国省代码: | 广东;44 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 存储文件 生物序列 预设条件 终端设备 源文件 并行 计算机可读存储介质 复制 信息处理技术 比对结果 获取目标 预设文件 检测 比对 副本 存储 | ||
1.一种DNA检测的方法,其特征在于,包括:
获取目标源文件,所述目标源文件包括生物序列信息;
判断所述生物序列信息中是否包含符合预设条件的DNA序列;
若所述生物序列信息中包含符合预设条件的DNA序列,提取所述符合预设条件的DNA序列,并将所述DNA序列存储至第一存储文件;
复制所述第一存储文件,把复制得到的多个第一存储文件副本与多组预设文件做并行比对,以获得并行比对结果。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,在获取并行比对结果后,还包括:
将并行比对结果进行合并。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述把复制得到的多个第一存储文件副本与多组预设文件做并行比对,以获得并行比对结果包括:
通过至少两个进程把复制得到的多个第一存储文件副本与多组预设文件做并行比对,其中,在每一进程中单独使用一个所述第一存储文件副本以用于与预设文件的比对;
将不同进程的所述第一存储文件副本与所述预设文件的比对结果分别存储至不同的比对文件中。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述通过至少两个进程把复制得到的多个第一存储文件副本与多组预设文件做并行比对包括:
依据所述进程总数分配进行并行比对的预设文件,并随机将多组预设文件与各个进程相匹配,若预设文件的组数超出进程总数,则等待已有进程结束后再将未比对的预设文件与进程进行匹配;
比对所述第一存储文件副本与所述预设文件是否满足预设的对应关系。
5.如权利要求1至4任意一项所述的方法,其特征在于,所述多组预设文件中分别存储了不同的预设DNA序列,其中每组预设文件中包括至少一个预设DNA序列。
6.一种DNA检测的装置,其特征在于,包括:
获取模块,用于获取目标源文件,所述目标源文件包括生物序列信息;
判断模块,用于判断所述生物序列信息中是否包含符合预设条件的DNA序列;
存储模块,用于若所述生物序列信息中包含符合预设条件的DNA序列,提取所述符合预设条件的DNA序列,并将所述DNA序列存储至第一存储文件;
比对模块,用于复制所述第一存储文件,把复制得到的多个第一存储文件副本与多组预设文件做并行比对,以获得并行比对结果。
7.如权利要求6所述的装置,其特征在于,所述比对模块具体包括:
比对单元,用于通过至少两个进程把复制得到的多个第一存储文件副本与多组预设文件做并行比对,其中,在每一进程中单独使用一个所述第一存储文件副本以用于与预设文件的比对;
存储单元,用于将不同进程的所述第一存储文件副本与所述预设文件的比对结果分别存储至不同的比对文件中。
8.如权利要求7所述的装置,其特征在于,所述比对单元具体用于:
依据所述进程总数分配进行并行比对的预设文件,并随机将多组预设文件与各个进程相匹配,若预设文件的组数超出进程总数,则等待已有进程结束后再将未比对的预设文件与进程进行匹配;
比对所述第一存储文件副本与所述预设文件是否满足预设的对应关系。
9.一种终端设备,包括存储器、处理器以及存储在所述存储器中并可在所述处理器上运行的计算机程序,其特征在于,所述处理器执行所述计算机程序时实现如权利要求1至5任一项所述方法的步骤。
10.一种计算机可读存储介质,所述计算机可读存储介质存储有计算机程序,其特征在于,所述计算机程序被处理器执行时实现如权利要求1至5任一项所述方法的步骤。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于深圳劲宇生物科技有限公司,未经深圳劲宇生物科技有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201810380856.4/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 同类专利
- 专利分类
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用