[发明专利]一种菠萝染色体二级结构的样品制备方法在审
申请号: | 201810382003.4 | 申请日: | 2018-04-26 |
公开(公告)号: | CN108611345A | 公开(公告)日: | 2018-10-02 |
发明(设计)人: | 秦源;赵丽华;蔡汉阳;侯志敏;张曼;陈票娟 | 申请(专利权)人: | 福建农林大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 蔡学俊 |
地址: | 350002 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 菠萝 染色体 二级结构 样品制备 细胞核 酶解缓冲液 电泳 菠萝叶片 功能基因 数据支持 样品处理 裂解液 构象 酶切 条带 遗传 回收 配置 研究 | ||
1.一种菠萝染色体二级结构的样品制备方法,其特征在于:所述方法包括如下步骤:
(1)溶液的配制:
核裂解液含有:0.25M蔗糖,pH6.8 PIPES 15mM,5mM MgCl2,60mM KCl,15mM NaCl,1mMCaCl2,0.9wt.%Triton X-100,用前加100ul cocktail和1mM PMSF;
酶解缓冲液含有:10wt.%蔗糖,pH 7.5 50mM Tris-HCl,4mM MgCl2,1mM CaCl2;
(2)材料的获得:
取菠萝嫩的叶片研磨达成细粉末状;
(3)样品处理
将研磨好的菠萝叶片粉末转移至50ml离心管,加入核裂解液,至40ml;4℃ 处理30分钟;
(4)提取细胞核
将处理好的样品分两管,4℃,4000转/min,离心20分钟;去上清,1ml核核裂解液重悬沉淀,转移至1.5ml离心管,4℃,4000转/min,离心20分钟;可再洗一次沉淀,直至沉淀颜色较白;
(5)酶切
沉淀用1ml的酶解缓冲液悬浮,加0.1UM Nase核酸酶,37℃反应10分钟,加20μl 的0.5M、pH 8.0 EDTA终止反应;
(6)电泳回收条带
12000g 离心10分钟,取上清,分两管,加入等体积的酚:氯仿抽提一次,酚:氯仿体积比为1:1,然后加入2倍体积乙醇在-20℃下沉淀DNA 20分钟;12000g离心10分钟,取沉淀,75%乙醇洗一次;电泳并回收200bp DNA条带;
(7)准备样品送测序或者PCR
回收试剂盒回收目的条带后,进行PCR反应,或者建库后送测序,即获得菠萝染色体二级结构。
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