[发明专利]一种新型分子标记及其在制备用于肾透明细胞癌诊断和预后的试剂盒中的应用

说明书

本发明公开了一种新型分子标记及其在制备用于肾透明细胞癌诊断和预后的试剂盒中的应用，所述新型分子标记的RNA序列如SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:57所示。以本发明标记物为基础，构建肾透明细胞癌诊断的数学模型；该模型灵敏度高，特异性好，AUC可高达0.997，诊断效果良好。此外，这57个tRF片段也可以作为肾透明细胞癌分型及预测病人生存期的分子标记物；在测试数据中，根据tRFs表达，肾透明细胞癌肿瘤样本被聚类成3个亚型，通过生存曲线分析显示这些亚型的生存期存在显著差异；本发明公开的新型的tRF分子标记物具有良好的诊断指标的特性，可以有效用于肾透明细胞癌诊断、分型和预后，具有较高的临床使用和推广价值。

技术领域

本发明涉及生物检测技术领域，具体涉及一种新型分子标记及其在制备用于肾透明细胞癌诊断和预后的试剂盒中的应用。

背景技术

肾癌(肾细胞癌)是泌尿系统肿瘤中致死率最高的一种，是起源于肾实质泌尿小管上皮系统的恶性肿瘤，又称肾腺癌，是最常见的肿瘤之一，其发病率和死亡率约占全部肿瘤的2-3％。根据组织学结构，肾癌可以被分为多个亚型，其中，肾透明细胞癌(kidney clearcell renal carcinoma，KIRC)是肾癌中最常见的一种亚型，约占70-80％，每年全世界大约会有102,000例患者因此而死亡。肾透明细胞癌是一种发展相对较慢的肿瘤，其早期症状常缺乏特异性，很多肾透明细胞癌发现时多已属中晚期，且出现了远处转移。因此对于肾透明细胞癌的治疗还是应注重早期发现早期诊断早期治疗。此外，肾透明细胞癌对化疗及放疗均不敏感，行手术切除是惟一治愈的方法。然而，肾透明细胞癌组织学行为多变,预后有不确定性，近30％的患者术后肿瘤复发。因此，寻找敏感的肾透明细胞癌标记物用以早期发现肿瘤，并能判断患者预后，早期发现复发，指导个体化治疗具有更重要的临床意义。近来，随着各组学技术和生物信息学分析技术的飞速发展，能够检测和分析数以百计不同的生物分子表达包括DNA，RNA和蛋白质，使筛选出对肾透明细胞癌诊断和预后判断准确的生物分子标记物成为可能。

生物标记物是指能将机体的生理和疾病状态区分开来的生物分子，筛选到可用于疾病早期发现、早期诊断的生物标志物可大大提高患者的临床治疗效果。tRNA是一类生物体中非常重要的非编码RNA，主要功能是转运氨基酸、参与蛋白合成。最近研究发现tRNA在各种逆境下会发生降解，产生20-40bp的小RNA片段，称为tRNA-derived RNA fragments，简称tRF。本研究团队最新数据显示肿瘤组织普遍具有特征性的tRF表达谱，即指肿瘤细胞中某些tRF的表达水平异常，而这种异常的特征性tRF可以成为用于肿瘤或疾病的诊断，病理分级，临床分期，治疗与预后的生物标志物，显示了较好的临床应用前景。我们分析了TCGA数据库中544例肾透明细胞癌测序数据，首次发现了肾透明细胞癌肿瘤组织中存在大量这种tRF片段，该种新型的分子标记物将有望成为肾透明细胞癌诊断筛查及分型预后效果预测的重要手段。

发明内容

本发明的目的在于针对现有技术的不足，提供一种新型分子标记及其在制备用于肾透明细胞癌诊断和预后的试剂盒中的应用。

本发明的目的是通过以下技术方案来实现的，一种新型分子标记，它的RNA序列如SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:57所示。

进一步地，它通过以下方法获取：