[发明专利]一种检测致泻病原微生物的核酸组合及其应用在审
申请号: | 201810388783.3 | 申请日: | 2018-04-26 |
公开(公告)号: | CN108546781A | 公开(公告)日: | 2018-09-18 |
发明(设计)人: | 周均;李文静;张红光;黄莉 | 申请(专利权)人: | 四川华汉三创生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6837;C12Q1/10;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) 11371 | 代理人: | 杨彦鸿 |
地址: | 610000 四川省成都市高*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 病原微生物 种检测 核酸 微生物检测 灵敏度 引物 应用 | ||
1.一种检测致泻病原微生物的核酸组合,其特征在于,其包括:如下引物对中的一种或多种的组合:
用于检测沙门氏菌invA基因且包括SEQ ID NO.1所示的上游引物和SEQ ID NO.2所示的下游引物的第一引物对;
用于检测沙门氏菌ttr基因且包括SEQ ID NO.3所示的上游引物和SEQ ID NO.4所示的下游引物的第二引物对;
用于检测痢疾菌ipaH基因且包括SEQ ID NO.5所示的上游引物和SEQ ID NO.6所示的下游引物的第三引物对;
用于检测霍乱弧菌ompW基因且包括SEQ ID NO.7所示的上游引物和SEQ ID NO.8所示的下游引物的第四引物对;
用于检测霍乱弧菌ctxAB基因且包括SEQ ID NO.9所示的上游引物和SEQ ID NO.10所示的下游引物的第五引物对;
用于检测副溶血性弧菌toxR基因且包括SEQ ID NO.11所示的上游引物和SEQ IDNO.12所示的下游引物的第六引物对;
用于检测副溶血性弧菌tdh基因且包括SEQ ID NO.13所示的上游引物和SEQ ID NO.14所示的下游引物的第七引物对;
用于检测副溶血性弧菌trh基因且包括SEQ ID NO.15所示的上游引物和SEQ ID NO.16所示的下游引物的第八引物对;
用于检测空肠弯曲菌hipO基因且包括SEQ ID NO.17所示的上游引物和SEQ ID NO.18所示的下游引物的第九引物对;
用于检测腺病毒且包括SEQ ID NO.19所示的上游引物和SEQ ID NO.20所示的下游引物的第十引物对;
用于检测札如病毒且包括SEQ ID NO.23所示的上游引物和SEQ ID NO.24所示的下游引物的第十一引物对;
用于检测星状病毒且包括SEQ ID NO.25所示的上游引物和SEQ ID NO.26所示的下游引物的第十二引物对;
用于检测轮状病毒且包括SEQ ID NO.27所示的上游引物和SEQ ID NO.28所示的下游引物的第十三引物对;
用于检测诺如病毒GI型且包括SEQ ID NO.29所示的上游引物和SEQ ID NO.30所示的下游引物的第十四引物对;
以及,用于检测诺如病毒GII型且包括SEQ ID NO.31所示的上游引物和SEQ ID NO.32所示的下游引物的第十五引物对。
2.根据权利要求1所述的核酸组合,其特征在于,所述核酸组合还包括碱基序列如SEQID NO.35-49所示的探针中的一种或多种。
3.根据权利要求1或2所述的核酸组合,其特征在于,所述核酸组合还包括内参引物对,所述内参引物对中的上游引物的碱基序列如SEQ ID NO.21所示,所述内参引物对中的下游引物的碱基序列如SEQ ID NO.22所示。
4.根据权利要求3所述的核酸组合,其特征在于,所述核酸组合还包括内参探针,所述内参探针的碱基序列如SEQ ID NO.50所示。
5.根据权利要求1或2所述的核酸组合,其特征在于,所述核酸组合还包括外参引物对,所述外参引物对中的上游引物的碱基序列如SEQ ID NO.33所示,所述外参引物对中的下游引物的碱基序列如SEQ ID NO.34所示。
6.根据权利要求5所述的核酸组合,其特征在于,所述核酸组合还包括外参探针,所述外参探针的碱基序列如SEQ ID NO.51所示。
7.根据权利要求1或2所述的核酸组合,其特征在于,所述核酸组合还包括阳性对照探针,所述阳性对照探针的碱基序列如SEQ ID NO.52所示。
8.根据权利要求7所述的核酸组合,其特征在于,所述核酸组合还包括用于与阳性探针杂交结合的阳性寡核苷酸单链DNA分子,所述阳性寡核苷酸单链DNA分子的碱基序列如SEQID NO.54所示。
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