[发明专利]一种用于鉴定西瓜杂交种安然与黄凤凰纯度的SSR引物及方法在审
| 申请号： | 201810396186.5 | 申请日： | 2018-04-28 |
| 公开（公告）号： | CN108384878A | 公开（公告）日： | 2018-08-10 |
| 发明（设计）人： | 卢霞;阿门;邓志军;滕录华;司龙亭 | 申请（专利权）人： | 江苏绿港现代农业发展有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司： | 宿迁市永泰睿博知识产权代理事务所(普通合伙) 32264 | 代理人： | 陈臣 |
| 地址： | 223800 江苏省宿迁*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 西瓜杂交种 引物 父本特异性标记 母本特异性标记 核苷酸序列 上游引物 下游引物 杂交种子 扩增 快速检测 西瓜品种 父母本 混杂 | ||
1.一种用于鉴定西瓜杂交种安然与黄凤凰纯度的SSR引物，其特征在于：所述引物包括引物CISSR18153的上游引物CISSR18153-F和下游引物CISSR18153-R，所述上游引物CISSR18153-F 的核苷酸序列如SEQ ID NO.1 所示，所述下游引物CISSR18153-R 的核苷酸序列如SEQ ID NO.2 所示。
2.根据权利要求1所述的一种用于鉴定西瓜杂交种安然与黄凤凰纯度的SSR引物，其特征在于：
利用所述引物CISSR18153进行PCR扩增，在西瓜杂交种安然中能扩增出142bp的父本特异性标记和152bp的母本特异性标记；在西瓜杂交种黄凤凰中能扩增出152bp的父本特异性标记和142bp的母本特异性标记。
3.根据权利要求2所述的一种用于鉴定西瓜杂交种安然与黄凤凰纯度的SSR引物，其特征在于：
所述在西瓜杂交种安然中能扩增处152bp的母本特异性标记的核苷酸序列如SEQ IDN0.3所示，所述在西瓜杂交种安然中能扩增出142bp的父本特异性标记的核苷酸序列如SEQID N0.4所示；
所述在西瓜杂交种黄凤凰中能扩增出142bp的母本特异性标记的核苷酸序列如SEQ IDN0.5所示，所述在西瓜杂交种黄凤凰中能扩增出152bp的父本特异性标记的核苷酸序列如SEQ ID N0.6所示。
4.一种用于鉴定西瓜杂交种安然与黄凤凰纯度的方法，其特征在于：包括以下步骤：
（1）提取西瓜杂交种安然或黄凤凰的亲本或其杂交后代的基因组DNA；
（2）利用权利要求1-3任一一项所述的引物CISSR09643对提取西瓜杂交种安然或黄凤凰的亲本或其杂交后代的基因组DNA进行PCR扩增；
（3）对步骤(2)的PCR扩增产物进行8%的聚丙烯酰胺凝胶电泳检测；
（4）对步骤(3)电泳检测结果进行分析，真正杂交种的标准图谱为同时具有两个亲本特异性序列的图谱，否则为假杂种，利用统计结果计算杂交种子纯度；其中：
若在西瓜杂交种安然中能扩增142bp的父本特异性标记和152bp的母本特异性标记，则为真正杂交种，否则为假杂种；
若在西瓜杂交种黄凤凰中能扩增152bp的父本特异性标记和142bp的母本特异性标记，则为真正杂交种，否则为假杂种。
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