[发明专利]用于检测口蹄疫病毒和塞尼卡谷病毒的实时荧光定量RT-PCR试剂盒及其应用在审
申请号: | 201810415406.4 | 申请日: | 2018-05-03 |
公开(公告)号: | CN108384893A | 公开(公告)日: | 2018-08-10 |
发明(设计)人: | 郑海学;田宏;杨帆;石正旺;朱紫祥;李丹;张克山;曹伟军;刘永杰;郭建宏;何继军;马旭升;茹毅;李林林;刘湘涛 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院兰州兽医研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12R1/93 |
代理公司: | 北京科龙寰宇知识产权代理有限责任公司 11139 | 代理人: | 孙皓晨;马鑫 |
地址: | 730046 甘肃*** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 口蹄疫病毒 试剂盒 病毒 实时荧光定量 定量分析 待检样品 检测 应用 大中型养殖场 提取病毒RNA 核酸提取液 基层兽医站 试剂盒检测 标准曲线 病原检测 科研单位 酶混合液 起始模板 阳性对照 阴性对照 荧光信号 反应管 反转录 拷贝数 灵敏度 探针 引物 优选 分析 | ||
1.一种用于检测口蹄疫病毒和塞尼卡谷病毒的一步直扩Taqman实时荧光定量RT-PCR试剂盒,其特征在于,包含分别用于检测口蹄疫病毒以及塞尼卡谷病毒的引物以及探针,其中用于检测塞尼卡谷病毒的引物由上游引物和下游引物组成,上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,下游引物的的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,所述的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示;用于检测口蹄疫病毒的引物由上游引物和下游引物组成,上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,下游引物的的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示,所述的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示。
2.如权利要求1所述的Taqman实时荧光定量RT-PCR试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒中还包含核酸提取液、2×Direct qRT-PCR Mix、酶混合液、阳性对照以及阴性对照。
3.如权利要求1所述的Taqman实时荧光定量RT-PCR试剂盒,其特征在于,所述探针的5’端标记荧光报告基团;所述探针的3’端标记小沟结合物和荧光淬灭基团。
4.如权利要求1所述的Taqman实时荧光定量RT-PCR试剂盒,其特征在于,用于检测口蹄疫病毒以及塞尼卡谷病毒的引物以及探针按照摩尔比1:1:1:1:1:1混合,其终浓度均为10pmol/μL。
5.如权利要求1所述的Taqman实时荧光定量RT-PCR试剂盒,其特征在于,用于检测塞尼卡谷病毒的探针的5’端标记荧光报告基团HEX;所述探针的3’端标记小沟结合物MGB和荧光淬灭基团BHQ-1,用于检测口蹄疫病毒的探针的5’端标记荧光报告基团FAM;所述探针的3’端标记小沟结合物MGB和荧光淬灭基团BHQ-1。
6.如权利要求1所述的Taqman实时荧光定量RT-PCR试剂盒,其特征在于,所述的核酸提取液按照以下方法制备得到:将异硫氰酸胍25g溶于33ml CSB缓冲液中,混合至完全溶解,其中CSB缓冲液中含有:42mM柠檬酸钠;0.83%w/v N-lauryl sarcosine(十二烷基肌氨酸钠);0.2mMβ-巯基乙醇。
7.如权利要求1所述的Taqman实时荧光定量RT-PCR试剂盒,其特征在于,所述的阳性对照为含有SEQ ID NO.7以及SEQ ID NO.8所示序列的质粒,所述的阴性对照为无RNA酶水。
8.如权利要求1-7任一项所述的Taqman实时荧光定量RT-PCR试剂盒,其特征在于,用于检测口蹄疫病毒和塞尼卡谷病毒时,按照以下步骤进行:
(1)PCR总体系为50μl,包括:
a.2×Direct qRT-PCR Mix:37μL;b.混合酶液:2μL;c.浓度均为10pmol/μl的引物以及探针的混合液:6μL,将上述成分分别依次加入到0.2ml扩增管中;
(2)向步骤(1)的扩增管中加入加待检样本5μl,12000rpm离心5-30秒,将扩增管放入扩增仪中,在以下设定程序下扩增:50℃逆转录10min;95℃预变性3min;95℃变性15s,60℃退火30s,40个循环,同时设立阴性对照以及阳性对照,直接在实时定量扩增仪上观察扩增结果;
(3)结果分析
根据扩增结果判定:单独选取FAM,在阴性对照没有Ct值的情况下,Ct值≤35判为口蹄疫病毒阳性;Ct值>35为口蹄疫病毒阴性;单独选取HEX,在阴性对照没有Ct值的情况下,Ct值≤35判为塞尼卡谷病毒阳性;Ct值>35为塞尼卡谷病毒阴性。
9.如权利要求8所述的Taqman实时荧光定量RT-PCR试剂盒,其特征在于,所述的待检样本为经过核酸提取液处理后的样本。
10.权利要求1-9任一项所述的Taqman实时荧光定量RT-PCR试剂盒在制备同时检测口蹄疫病毒以及塞尼卡谷病毒试剂中的用途。
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