[发明专利]用于鉴定大肠杆菌O161抗原血清型的特异性分子标识及方法

说明书

本发明提供了一种用于鉴定大肠杆菌O161抗原血清型的特异性分子标识，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1‑4所示。本发明还提供了一种用于鉴定大肠杆菌O161抗原血清型的方法。本发明的用于鉴定大肠杆菌O161抗原血清型的特异性分子标识和方法操作便捷、特异性强、准确率高。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及用于鉴定大肠杆菌O161血清型的特异性分子标识。

背景技术

大肠杆菌(Escherichia coli,E.coli)是研究得最为广泛的模式菌，其按致病性特点分为共生型、肠内致病性E.coli(Intraintestinal pathogenic E.coli,IPEC)和肠外致病性E.coli(Extraintestinal pathogenic E.coli,ExPEC)。ExPEC能定殖、侵袭宿主肠外组织并引发一系列感染，包括泌尿道感染、呼吸道感染、脑膜炎、败血症、肺炎和心内膜炎等。华中农业大学陈焕春院士团队2004年以来在我国发病猪场进行流行病学调查，结果显示猪源ExPEC已成为严重威胁我国养猪业发展的重要病原菌，并且在我国猪源ExPEC的优势血清型依此为O11、O8、O138、O161和O101。

E.coli的血清分型是基于体壁(O)、鞭毛(H)和荚膜抗原(K)。O-抗原是革兰氏阴性菌重要的表面多糖，是重复的多糖复合体，由于糖种类和排列顺序的多样性，O-抗原具有高度多变性。目前已报道的E.coli O抗原的种类有173种。传统鉴定大肠杆菌O-抗原血清型的方法是利用特异的抗血清进行凝集反应，不同的O-抗原可能对某一特定的血清型是特异的，但不同的血清型也可能有相同的抗原决定簇，从而导致了不同的血清型有交叉反应。此外血清型鉴定的方法还较为费时、费力，因此目前也有通过快捷、准确、灵敏的分子生物学方法来鉴定O-抗原血清型。O-抗原合成基因簇位于细菌基因组中保守基因galF和gnd之间。O-抗原合成基因簇中主要包括三类基因：单糖合成酶基因、糖基转移酶基因和寡糖单位处理酶基因。不同O-抗原的糖基转移酶和寡糖单位处理酶基因的序列同源性较低，可以作为不同O-抗原血清型的特异性分子标识，用于分子生物学鉴定。

我国猪源ExPEC的优势血清O11、O8、O138、O161和O101中，O11和O138的O-抗原合成基因簇已经被破译，并筛选出相应的特异分子标识。