[发明专利]利用单细胞PCR检测细胞遗传稳定性的方法在审
申请号: | 201810446767.5 | 申请日: | 2018-05-11 |
公开(公告)号: | CN108611406A | 公开(公告)日: | 2018-10-02 |
发明(设计)人: | 董慧芳;徐嘉文;邱沛然;汤传龙;蔡洁行;周伟昌;陈智胜 | 申请(专利权)人: | 上海药明生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686 |
代理公司: | 上海浦一知识产权代理有限公司 31211 | 代理人: | 戴广志 |
地址: | 200131 上海市浦东新区中国(上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基因拷贝数 遗传稳定性 细胞遗传 裂解 单细胞水平 细胞 扩增产物 流式细胞 微观水平 样品提取 药品研发 均一性 细胞株 异质性 预扩增 质量控制 分选 高通 构建 蛋白 筛选 衡量 检测 生产 | ||
1.利用单细胞PCR检测细胞遗传稳定性的方法,其特征在于,步骤包括:
1)流式细胞进行单细胞分选及裂解;
2)对裂解后的样品提取DNA进行目标基因预扩增;
3)对预扩增产物进行目标基因及内参基因的qPCR;
4)根据基因拷贝数的变化衡量细胞的遗传稳定性。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述单细胞为中国仓鼠卵巢细胞。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤1),裂解方法为:25-55℃裂解,然后在65-100℃失活。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤1),裂解所用缓冲液的成分包括0.1%-5.0%蛋白酶K和0.001%-0.5%SDS。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤2),预扩增引物包括目标基因正向引物和反向引物。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤2),预扩增PCR反应条件为:90-95℃2-12min;90-95℃10-120s,50-65℃30-180s,68-72℃30-180s,共3-30个循环。
7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤3),qPCR反应条件为:90-95℃2-12min;90-95℃10-120s,50-65℃30-180s,68-72℃30-180s,共20-50个循环。
8.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤4),根据基因拷贝数的变化,用目标基因丢失率、两组Ct平均值的差值、样品标准差三个指标衡量细胞的遗传稳定性。
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