[发明专利]急性红白血病KEL基因及其转录出的环状RNA分子标记物有效

专利信息
申请号: 201810448017.1 申请日: 2018-05-11
公开(公告)号: CN108588068B 公开(公告)日: 2021-10-01
发明(设计)人: 金晖;孙汉东;孙志强;伍紫娟;霍海芹;刘文洁;刘延风 申请(专利权)人: 金晖
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/6886
代理公司: 南京业腾知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 32321 代理人: 郑婷
地址: 210029 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 急性 白血病 kel 基因 及其 转录 环状 rna 分子 标记
【说明书】:

发明公开了一种急性红白血病KEL基因及其转录出的环状RNA(circ‑KEL)分子标记物以及相关的检测试剂。与现有技术相比,本发明的检测试剂具有检测灵敏度高、特异性强、快速且检测方法简单。

技术领域

本发明涉及分子生物学技术领域,具体的涉及一种急性红白血病KEL基因及其转录出的环状RNA(circ-KEL)分子标记物。

背景技术

急性红白血病(acute erythroid leukemia,AEL)是一类少见的血液系统恶性疾病,可同时累及多个细胞系,其主要不成熟成分是原始红细胞。该病可发生于任何年龄组,儿童罕见,在白血病中占2.89%。AEL作为急性髓细胞白血病(acute myeloidleukemia,AML)中的一种少见亚型(M6型AML),在AML中发病率低于5%。关于该病大宗临床报道较少,临床表现各异,且具有较强的异质性。目前,临床上AEL的治疗方案和其他类型AML基本一致,仍以蒽环类药物联合阿糖胞苷为主。AEL发病机制不明,且至今未发现相关分子标志物作为诊断标准。

白血病在我国人群中发病率高,近年来其发病率呈上升趋势,病因至今尚未阐明。目前公认的观点是白血病是环境-基因相互作用引起的。基因方面涉及代谢、DNA损伤修复基因等的变异。研究发现,致癌物代谢通路中的代谢酶家族在人群中呈多态性,不同个体对特定致癌物的代谢能力有巨大的差异。同样,DNA修复能力也存在显著的个体差异。人类基因组计划研究成果表明,每个人的基因都是一样的,但在序列上有极小的变异如单核苷酸多态(SNPs)。正是这些基因的SNP多态性导致了基因产物的功能差异,从而决定个体对引起白血病发病的特定致癌物的代谢能力及DNA损伤后修复能力的不同。因此,代谢类基因、DNA修复基因等的多态性是决定人群对白血病易感性的遗传因素。

白血病患者的遗传学特征异常复杂多变,包括染色体的易位、缺失、突变和倒位等,这些染色体易位畸变时大部分情况下会产生新的融合基因,这些融合基因可作为诊断不同类型白血病的分子标志,此外,不同类型的白血病化疗和放疗的治疗方案亦不同。因此,融合基因的检测对白血病的诊断、预后、监测微小残留病和指导用药等具有重要的指导价值,已成为白血病诊断标准最重要的指标之一。

现有技术检测白血病易感人群,采用杂交芯片法或玻璃板芯片法,以及利用taqman探针,该方法准确率低、假阴性和假阳性率较高,且不能批量检测;另一种直接测序法,虽准确率高,但其成本高、同样不能实现批量检测,因此现有方法均无法满足大规模基因筛选的要求。

环状RNA(circRNA)是新近确认的一类特殊的非编码RNA,是RNA剪接后所形成的一类极稳定的保守型产物,circRNA可作为miRNA“海绵”来影响对应靶基因的调控与表达,通过与疾病关联的miRNA相互作用,在疾病中发挥着重要的调控作用。有研究人员发现circRNA在动脉粥样硬化、神经系统紊乱、糖尿病和肿瘤等疾病发生过程中发挥着非常重要的作用。目前,已有研究证实circRNA在胃癌和非癌组织的表达量存在显著差异,是临床上具有潜在诊断价值的新型生物标志物。迄今为止,KEL基因在AEL中的作用尚无报道,对AEL发病机制的研究仍处于起步阶段,国内外还没有公开任何关于利用KEL基因及其转录出的circRNA分子作为急性红白血病预测和诊断的分子标志物的相关研究报道。

发明内容

本发明的目的在于提供一种急性红白血病KEL基因及其转录出的环状RNA(circ-KEL)分子标记物,以便于特异性、简单的对白血病进行检测。为了实现本发明的目的,拟采用如下技术方案:

本发明一方面涉及一种急性红白血病KEL基因,其特征在于在急性红白血病患者的血液样本中特异性高表达。

本发明另一方面涉及上述急性红白血病KEL基因所转录出的环状RNA(circ-KEL)分子标记物。

本发明涉及一种检测试剂,其特征在于该检测试剂包括如下引物:

KEL-F:5’-GGATCTCCGGGATCATTACCT-3’和

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