[发明专利]代谢组学组织样本处理方法在审
申请号: | 201810472994.5 | 申请日: | 2018-05-17 |
公开(公告)号: | CN108680410A | 公开(公告)日: | 2018-10-19 |
发明(设计)人: | 许丽;倪君君;邱天祎 | 申请(专利权)人: | 北京和合医学诊断技术股份有限公司 |
主分类号: | G01N1/28 | 分类号: | G01N1/28 |
代理公司: | 北京双收知识产权代理有限公司 11241 | 代理人: | 解政文 |
地址: | 101111 北京市大兴区北京*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 收集装置 器皿 匀浆 组织样本 代谢组学 组学 生理盐水清洗 低温离心机 均匀液体 人体代谢 组织代谢 研磨 上清液 样本 平衡 | ||
本发明代谢组学组织样本处理方法,它包括以下步骤:将人体代谢组学组织样本用生理盐水清洗干净;并置于第一匀浆器皿、第二匀浆器皿和第三匀浆器皿中,然后在第一匀浆器皿、第二匀浆器皿和第三匀浆器皿中分别加入试剂1、试剂2和试剂3进行研磨;将呈均匀液体状态的代谢组学组织样本分别转移至第一收集装置、第二收集装置内和第三收集装置内,立即将第一收集装置、第二收集装置和第三收集装置于已平衡至4℃的低温离心机中进行离心,得到上清液即为三个组织代谢组学样本。
技术领域
本发明涉及分析化学和代谢组学领域,尤其是代谢组学组织样本处理方法。
背景技术
代谢组学是系统生物学的重要组成部分,其通过定性鉴别和定量描述生物基质中小分子代谢物的表达与修饰变化,寻找代谢物与生理病理变化的相对关系。目前,代谢组学已在疾病诊断和动物模型、药物毒性和机理研究、基因功能的阐明等领域获得了广泛应用。虽然血液、尿液等生物体液获得方式简单,且其代谢物与细胞、组织和整体水平的生物化学状态相关,但很多疾病引起的代谢通路改变可能只有在局部微环境下才可以检测得到,因此,组织研究在代谢组学研究中一直备受关注。
在代谢组学研究中,代谢组学组织样本的代谢物提取率、精密度和重现性好坏等决定了是否可以准确地观察到机体的代谢变化情况。代谢组学组织样本中代谢物种类繁多,物理性质差异较大,也部分代谢物含量很低,其提取过程受到提取溶剂系统、提取方式、酶活性等诸多方面的影响。目前常规的提取和处理方法过程繁琐,提取和处理过程易污染,且易伴随代谢物受生物酶等影响而导致的含量改变问题,此外,由于往往采用单一的提取液,也会造成代谢物提取不完全。
发明内容
针对上述技术问题,本发明目的是提供一种代谢组学组织样本处理方法。该方法具有提取过程简单、提取完全、可操作性强、安全环保等特点,可广泛用于代谢组学研究。
本发明采用以下技术方案:
本发明一种代谢组学组织样本处理方法,它包括以下步骤:
(1)收集代谢组学组织样本,将上述代谢组学组织样本用生理盐水清洗干净;
(2)分别称取20-30mg洗净的代谢组学组织样本,并置于第一匀浆器皿、第二匀浆器皿和第三匀浆器皿中,然后在上述第一匀浆器皿、第二匀浆器皿和第三匀浆器皿中分别加入200-1000μl的试剂1、试剂2和试剂3,进行研磨,研磨至上述三份洗净的代谢组学组织样本均呈均匀液体状态;
(3)将步骤(2)中的呈均匀液体状态的代谢组学组织样本分别转移至第一收集装置、第二收集装置和第三收集装置内;
(4)立即将上述第一收集装置、第二收集装置和第三收集装置置于已平衡至4-8℃的低温离心机中进行离心,离心速度为8000-10000rpm,离心时间为5-10min,得到上清液即为三个组织代谢组学样本。
(5)将上述三个组织代谢组学样本同时上机进行分析;
本发明一种代谢组学组织样本处理方法,其中:所述试剂1为含3-8%TCA的纯水;试剂2为甲醇;试剂3为含3-8%TCA的50%甲醇水溶液;
本发明一种代谢组学组织样本处理方法,其中:称取三氯乙酸固体,分别用纯水和50%甲醇水溶液溶解,得到含3%-8%TCA的纯水的试剂1,和含3-8%TCA的50%甲醇水溶液的试剂3;
本发明一种代谢组学组织样本处理方法,其中:所述试剂1为含5%TCA的纯水;试剂3为含5%TCA的50%甲醇水溶液;
本发明一种代谢组学组织样本处理方法,其中:所述第一收集装置、第二收集装置内和第三收集装置为2ml塑料离心管。
本发明有益效果:
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