[发明专利]一种与萝卜晚抽薹性状相关的基因及其应用

说明书

本发明提供了一种与萝卜晚抽薹性状相关的基因及其应用，属于基因工程技术领域，具有SEQ ID No.1所示的核苷酸序列。本发明提供的基因能够使萝卜晚抽薹开花。

技术领域

本发明涉及基因工程技术领域，尤其涉及一种与萝卜晚抽薹性状相关的基因及其应用。

背景技术

萝卜起源于我国，是我国重要的蔬菜作物，长期以来是我国城乡居民的“当家菜”。年播种面积1600万亩，占我国整个蔬菜生产的6％。萝卜是长日照植物，通过低温春化后在长日照条件下由营养生长转向生殖生长，从而抽薹开花。未熟抽薹开花对萝卜生产最重要的影响是营养生长向生殖生长的转变，抑制肉质根的膨大，导致产量和品质下降。发现萝卜晚抽薹基因以及培育萝卜晚抽薹品种是解决这一问题的根本途径。

基于高通量RNA测序技术，在萝卜中鉴定了与晚抽薹开花性状相关的基因，发现了大量差异表达基因及控制抽薹开花的关键基因如FT、CO、SOC1、FLC和LFY。通过转录组分析，发现3个同源FLC基因(RsFLC1、RsFLC2和RsFLC3)，分别位在Rs7、Rs2和Rs3染色体上(Yi etal.2014；Kitashiba et al.2014)。RsFLC基因位点上存在明显的序列变异，但是未找到与萝卜晚抽薹性状相关的新的基因序列。

发明内容

本发明的目的在于提供一种与萝卜晚抽薹性状相关的基因，该基因能够使萝卜晚抽薹开花。

为了实现上述发明目的，本发明提供以下技术方案：

本发明提供了一种与萝卜晚抽薹性状相关的基因，具有SEQ ID No.1所示的核苷酸序列。

本发明还提供了上述技术方案所述的基因在鉴别萝卜抽薹性状中的应用。

优选的，所述鉴别萝卜抽薹性状的方法，包括以下步骤：

将待测萝卜的基因组DNA进行PCR扩增，得到扩增产物，所述PCR扩增使用的引物为1F和1R，所述1F具有SEQ ID No.2所示的核苷酸序列，所述1R具有SEQ ID No.3所示的核苷酸序列；

当所述扩增产物的片段为2417bp，且包含上述技术方案所述的基因时，所述萝卜抽薹性状为晚抽薹性状；

当所述扩增产物的片段为790bp，且不包含上述技术方案所述的基因时，所述萝卜抽薹性状为早抽薹性状。

优选的，所述PCR扩增的反应体系每30μl包括：100ng基因组DNA，2μl 10×PCRBuffer，1.6μl dNTPs，浓度为10μM的1F 0.4μl，浓度为10μM的1R 0.4μl，1.5μl Taq酶，24.1μl ddH₂O。

优选的，所述PCR扩增的程序为：94℃预变性4min；94℃变性30s，60℃退火1min，72℃延伸1.5min，35个循环；72℃延伸10min；4℃保存。本发明还提供了上述技术方案所述的基因序列在萝卜育种中的应用，所述萝卜育种的方法包括：利用上述技术方案所述的步骤，选择基因组中包含上述技术方案所述基因的待测萝卜作为亲本进行育种。

本发明提供了一种与萝卜晚抽薹性状相关的基因，该基因与萝卜晚抽薹开花性状相关。萝卜为两年生作物，抽薹开花鉴定时间较长，利用本发明作为鉴定萝卜品种抽薹性状和辅助选择育种亲本应用时，能够在苗期对待测品种进行抽薹性鉴定，节省植株田间管理成本和时间。

本发明实施例的结果显示：本发明提供的基因能够使萝卜晚抽薹开花。

附图说明

图1为萝卜抽薹开花时间性状QTL定位信息，A：抽薹开花时间初步定位于InDel162和InDel170标记之间；B：局部加密的萝卜R02染色体，候选基因RsFLC2位于标记InDel520和InDel535之间；