[发明专利]检测蟹爪兰X病毒所用PCR引物对、检测方法及其应用在审
申请号: | 201810492000.6 | 申请日: | 2018-05-22 |
公开(公告)号: | CN108624717A | 公开(公告)日: | 2018-10-09 |
发明(设计)人: | 柏自琴;郑乾明;李兴忠;王小柯;刘涛;马玉华 | 申请(专利权)人: | 贵州省果树科学研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11;C12N15/70;C12R1/94 |
代理公司: | 贵阳中新专利商标事务所 52100 | 代理人: | 李余江;程新敏 |
地址: | 550006 贵州*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 蟹爪兰 检测 应用 病毒 病毒侵染 上游引物 下游引物 仙人掌 火龙果 引物 | ||
1.一种检测蟹爪兰X病毒所用PCR引物对,其特征在于:包括上游引物SchVX CP-F:5’-GGTCATCACCGGAAACTGT-3’,下游引物SchVX CP-R:5’-CTTTGGGCTTTCAGATCCTT-3’。
2.一种采用如权利要求1所述的PCR引物对检测蟹爪兰X病毒的方法,其特征在于:该方法包括如下步骤:
步骤1.提取待检火龙果样品的总RNA;
步骤2.逆转录;
步骤3.PCR扩增。
3.根据权利要求2所述的检测蟹爪兰X病毒的方法,其特征在于:步骤3中PCR反应体系配制如下:
25μL扩增反应体系如下:
10×PCR缓冲液,2.5μL;
25mmol/L MgCl2,1.5μL;
2.5mmol/LdNTP,2.0μL;
上游引物SchVX CP-F,2.0μL;
下游引物SchVX CP-R,2.0μL;
模板cDNA(1ng/μL),2.0μL;
Taq DNA聚合酶,0.2μL;
无RNA酶去离子水,12.8μL。
4.根据权利要求2或3所述的检测蟹爪兰X病毒的方法,其特征在于:步骤3中PCR反应条件如下:在PCR热循环仪上设置程序,按程序设置的条件进行扩增:1)94℃预变性5min;2)94℃变性40sec;3)55℃退火50sec;4)72℃延伸50s;循环步骤2)~4)30次;5)72℃延伸8min。
5.根据权利要求2所述的检测蟹爪兰X病毒的方法,其特征在于:对步骤3中PCR反应产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,与阳性对照相比,若待检样品的扩增条带长度与阳性对照一致,则待检样品呈阳性,表明样品中含有蟹爪兰X病毒。
6.根据权利要求5所述的检测蟹爪兰X病毒的方法,其特征在于:将步骤3中待检样品的PCR扩增产物直接连于pMD18-T载体,转化大肠杆菌,挑取阳性克隆进行菌液PCR初步鉴定,对鉴定为阳性的菌株进一步测序,依据测序结果进行比对,确定是否感染蟹爪兰X病毒。
7.一种检测蟹爪兰X病毒所用PCR引物对在检测火龙果、仙人掌及蟹爪兰是否存在蟹爪兰X病毒侵染中的应用。
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