[发明专利]检测蟹爪兰X病毒所用PCR引物对、检测方法及其应用在审

专利信息
申请号: 201810492000.6 申请日: 2018-05-22
公开(公告)号: CN108624717A 公开(公告)日: 2018-10-09
发明(设计)人: 柏自琴;郑乾明;李兴忠;王小柯;刘涛;马玉华 申请(专利权)人: 贵州省果树科学研究所
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11;C12N15/70;C12R1/94
代理公司: 贵阳中新专利商标事务所 52100 代理人: 李余江;程新敏
地址: 550006 贵州*** 国省代码: 贵州;52
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摘要:
搜索关键词: 蟹爪兰 检测 应用 病毒 病毒侵染 上游引物 下游引物 仙人掌 火龙果 引物
【权利要求书】:

1.一种检测蟹爪兰X病毒所用PCR引物对,其特征在于:包括上游引物SchVX CP-F:5’-GGTCATCACCGGAAACTGT-3’,下游引物SchVX CP-R:5’-CTTTGGGCTTTCAGATCCTT-3’。

2.一种采用如权利要求1所述的PCR引物对检测蟹爪兰X病毒的方法,其特征在于:该方法包括如下步骤:

步骤1.提取待检火龙果样品的总RNA;

步骤2.逆转录;

步骤3.PCR扩增。

3.根据权利要求2所述的检测蟹爪兰X病毒的方法,其特征在于:步骤3中PCR反应体系配制如下:

25μL扩增反应体系如下:

10×PCR缓冲液,2.5μL;

25mmol/L MgCl2,1.5μL;

2.5mmol/LdNTP,2.0μL;

上游引物SchVX CP-F,2.0μL;

下游引物SchVX CP-R,2.0μL;

模板cDNA(1ng/μL),2.0μL;

Taq DNA聚合酶,0.2μL;

无RNA酶去离子水,12.8μL。

4.根据权利要求2或3所述的检测蟹爪兰X病毒的方法,其特征在于:步骤3中PCR反应条件如下:在PCR热循环仪上设置程序,按程序设置的条件进行扩增:1)94℃预变性5min;2)94℃变性40sec;3)55℃退火50sec;4)72℃延伸50s;循环步骤2)~4)30次;5)72℃延伸8min。

5.根据权利要求2所述的检测蟹爪兰X病毒的方法,其特征在于:对步骤3中PCR反应产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,与阳性对照相比,若待检样品的扩增条带长度与阳性对照一致,则待检样品呈阳性,表明样品中含有蟹爪兰X病毒。

6.根据权利要求5所述的检测蟹爪兰X病毒的方法,其特征在于:将步骤3中待检样品的PCR扩增产物直接连于pMD18-T载体,转化大肠杆菌,挑取阳性克隆进行菌液PCR初步鉴定,对鉴定为阳性的菌株进一步测序,依据测序结果进行比对,确定是否感染蟹爪兰X病毒。

7.一种检测蟹爪兰X病毒所用PCR引物对在检测火龙果、仙人掌及蟹爪兰是否存在蟹爪兰X病毒侵染中的应用。

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