[发明专利]CLALS蛋白、其编码基因及它们在预测西瓜除草剂抗性中的应用有效
申请号: | 201810500524.5 | 申请日: | 2018-05-23 |
公开(公告)号: | CN108707592B | 公开(公告)日: | 2022-06-28 |
发明(设计)人: | 许勇;田守蔚;姜临建;张海英;宫国义;郭邵贵;张洁;任毅;孙宏贺;李茂营 | 申请(专利权)人: | 北京市农林科学院 |
主分类号: | C12N9/10 | 分类号: | C12N9/10;C07K19/00;C12N15/62;C12N15/54;C12Q1/6895 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 100097 北京市海淀区彰化路*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | clals 蛋白 编码 基因 它们 预测 西瓜 除草剂 抗性 中的 应用 | ||
1.CLALS蛋白或编码所述CLALS蛋白的核酸分子在调控西瓜除草剂抗性中的应用;
所述除草剂为苯磺隆、吡嘧磺隆、苄嘧磺隆或砜嘧磺隆;
所述CLALS蛋白为如下c2)或c3):
c2)氨基酸序列是序列表中序列4所示的蛋白质;
c3)氨基酸序列是序列表中序列6所示的蛋白质;
所述编码所述CLALS蛋白的核酸分子为如下d2)或d3)所示的DNA分子:
d2)核苷酸序列是序列表中序列3所示的DNA分子;
d3)核苷酸序列是序列表中序列5所示的DNA分子。
2.CLALS蛋白或编码所述CLALS蛋白的核酸分子在培育除草剂抗性改变的西瓜中的应用;
所述除草剂为苯磺隆、吡嘧磺隆、苄嘧磺隆或砜嘧磺隆;
所述CLALS蛋白为如下c2)或c3):
c2)氨基酸序列是序列表中序列4所示的蛋白质;
c3)氨基酸序列是序列表中序列6所示的蛋白质;
所述编码所述CLALS蛋白的核酸分子为如下d2)或d3)所示的DNA分子:
d2)核苷酸序列是序列表中序列3所示的DNA分子;
d3)核苷酸序列是序列表中序列5所示的DNA分子。
3.一种预测待测西瓜除草剂抗性的方法,为检测待测西瓜的CLALS蛋白自N末端起第190位的氨基酸残基种类;所述CLALS蛋白为氨基酸序列是序列表中序列2、序列表中序列4或序列表中序列6所示的蛋白质;
“CLALS蛋白自N末端起第190位的氨基酸残基种类仅为非脯氨酸残基”的待测西瓜或“CLALS蛋白自N末端起第190位的氨基酸残基种类为非脯氨酸残基和脯氨酸残基”的待测西瓜的除草剂抗性强于“CLALS蛋白自N末端起第190位的氨基酸残基种类仅为脯氨酸残基”的待测西瓜;
所述非脯氨酸为丝氨酸或亮氨酸;
所述除草剂为苯磺隆、吡嘧磺隆、苄嘧磺隆或砜嘧磺隆。
4.一种预测待测西瓜除草剂抗性的方法,为检测待测西瓜总RNA的特定转录本中第190个密码子的核苷酸序列;所述特定转录本为权利要求3中所述CLALS蛋白的编码基因转录得到的RNA,其第1个密码子为起始密码子;
“特定转录本中第190个密码子的核苷酸序列仅编码非脯氨酸”的待测西瓜或“特定转录本中第190个密码子的核苷酸序列编码非脯氨酸和脯氨酸”的待测西瓜的除草剂抗性强于“特定转录本中第190个密码子的核苷酸序列仅编码脯氨酸”的待测西瓜;
所述非脯氨酸为丝氨酸或亮氨酸;
所述除草剂为苯磺隆、吡嘧磺隆、苄嘧磺隆或砜嘧磺隆。
5.一种预测待测西瓜除草剂抗性的方法,包括如下步骤:检测待测西瓜总DNA中是否具有序列表的序列1所示的DNA分子、序列表的序列3所示的DNA分子和序列表的序列5所示的DNA分子;
“待测西瓜总DNA中具有序列表的序列3所示的DNA分子和/或具有序列表的序列5所示的DNA分子”的待测西瓜的除草剂抗性强于“待测西瓜总DNA中仅具有序列表的序列1所示的DNA分子”的待测西瓜;
所述除草剂为苯磺隆、吡嘧磺隆、苄嘧磺隆或砜嘧磺隆。
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