[发明专利]一种基于SNP标记的紫龙三号茄子纯度鉴定的引物SmemboI-1及应用

说明书

本发明属于农业的蔬菜育种与分子检测技术领域，公开了一种基于SNP标记的紫龙三号茄子纯度鉴定的引物SmemboI‑1及应用，所述的引物为：SmemboI‑1‑F：5’‑CAATGAGAGGACGATTAATGACA‑3’和SmemboI‑1‑R：5’‑GGAAGACAAGAATAATAGTGTACATGC‑3’。该引物可对‘紫龙三号’及其母本、父本进行有效区分；本发明同时还公开了另一对引物SmemboI‑2，该引物可与引物SmemboI‑1结合一起对‘紫龙三号’及其母本、父本进行鉴定。本发明提供的引物和引物组合具有快速、准确、稳定和操作简便等优点，能够替代传统茄子杂交种田间纯度鉴定的方法，有较强的应用价值。

技术领域

本发明属于农业的蔬菜育种与分子检测技术领域，具体涉及一种基于SNP标记的紫龙三号茄子纯度鉴定的引物SmemboI-1及应用。

背景技术

种子纯度是种子质量检测最为重要的环节之一，植物新品种特异性(Distinctness)、一致性(Uniformity)和稳定性(Stability)的测试(简称DSU测试)是农业部植物新品种保护办公室对申请品种授予新品种权进行实质审查最重要的工作内容。传统的种子纯度鉴定方法是以播种后植株的田间形态观察为依据，观察杂交一代的农艺学性状来判断是否为假杂种，其鉴定周期长、工作量大、成本高，且易受环境、气候因素影响，易导致结果鉴定结果存在误差。目前，每年因种子纯度问题给农户造成大幅减产减收的事件时有发生，严重影响了农业生产和农民增收。因此，开发快速、准确的杂交种纯度鉴定方法已成为种子科研单位和企业最为关注的方向之一。

随着现代分子生物学技术的发展，出现了以DNA分子标记技术为基础的新型杂交种纯度鉴定方法，它具有简便、快速、准确等特点。常用的分子标记技术包括AFLP、RFLP、SRAP、SCAR、SSR和SNP等标记技术。SNP(Single Nucleotide Polymorphisms)是指在基因组上单个核苷酸的变异，主要包括转换、颠换等形成的遗传标记，其数量很多、分布广泛，且具有共显性和高多态性等特征。目前，普遍认为SNP标记是继RFLP和SSR之后最有前途的第三代分子标记。

茄子是茄科属草本作物，原产非洲，现已在亚洲、非洲、欧洲和近东等地区广为栽培，联合国农业组织(FAO)将茄子列为第四大世界性蔬菜作物。我国是茄子种植大国，其茄子类型和栽培方式多样，已成为我国南菜北调和北菜南运的主要蔬菜品种之一。由于在茄子杂交制种过程中，人工去雄不彻底和机械因素等原因，常会出现假杂交种，导致种子遗传纯度下降，给农业生产造成巨大的经济损失。

商品种‘紫龙三号’(原审定名称为‘鄂茄二号’)是武汉市农业科学院蔬菜研究所育成的紫色长茄品种，2007年通过湖北省农业厅的农作物新品种审定，目前为湖北地区夏秋主栽品种。本发明提供了两对基于SNP标记开发出来的CAPS引物，其实验操作简单，只需要最基本的分子实验配套仪器和条件，不需要进行有毒的聚丙酰胺凝胶电泳和硝酸银显色，检测结果准确、高效，可有效区分茄子‘紫龙三号’杂交种制种过程中母本、父本种子掺杂。迄今为止，尚未见到利用SNP标记鉴定茄子杂交种纯度的报道，本发明属于首次采用。

发明内容

本发明的目的是提供一种基于SNP标记的‘紫龙三号’茄子纯度鉴定的引物SmemboI-1，所述的引物为：SmemboI-1-F：5’-CAATGAGAGGACGATTAATGACA-3’和SmemboI-1-R：5’-GGAAGACAAGAATAATAGTGTACATGC-3’。

本发明的另一个目的在于提供一种基于SNP标记的‘紫龙三号’茄子纯度鉴定的引物组合，包括：SmemboI-1-F：5’-CAATGAGAGGACGATTAATGACA-3’、SmemboI-1-R：5’-GGAAGACAAGAATAATAGTGTACATGC-3’；和SmemboI-2-F：5’-TTTTGGGAACGCAAAGAGTT-3’、SmemboI-2-R：5’-TCTACTTCAGAACCTCCGCC-3’。