[发明专利]特异甲基化位点作为乳腺癌分子分型诊断标志物的应用

说明书

本发明公开了一种特异甲基化位点作为乳腺癌分子分型诊断标志物的应用。本发明确立了筛选疾病相关的染色体甲基化位点的方法和标准，并以乳腺癌为例筛选到与乳腺癌的诊断相关的40个甲基化位点。所筛选到的特异甲基化位点作为乳腺癌的分子分型诊断标志物，可用于无创的方式检测乳腺癌的分子分型等疾病诊断。其中，试剂盒用于选自以下用途中的一项或多项：乳腺癌分子分型的诊断、乳腺癌患病风险的评估、乳腺癌治疗效果的评估和乳腺癌治疗药物的筛选等。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体而言，涉及一种特异甲基化位点作为乳腺癌分子分型诊断标志物的应用。

背景技术

液体活检技术被MIT technology评为2015十大科技进展，为肿瘤耐药生物标志物研究提供了新的思路。液体活检相较于组织活检优势众多，如非介入性、可重复性地获得肿瘤样本，副作用小、操作简便、成本较低、检测速度快。

循环肿瘤DNA(cfDNA)携带了肿瘤DNA的突变和甲基化信息，利用cfDNA作为肿瘤标志物，检测结果的假阳性率低，灵敏度高，准确度高。大多数蛋白质肿瘤标志物能在血液中存在数周，cfDNA的半衰期只有不到两个小时，因此可以利用cfDNA实时监控肿瘤的发展。cfDNA逐渐成为肿瘤液体活检的经典检测对象之一。但由于cfDNA含量极低(纳克级别)、降解严重，液体活检发展遭遇瓶颈，正面临巨大的挑战。

癌症，又被称为恶性肿瘤，是由控制细胞生长增殖机制的失常而引起的疾病。正常情况下，细胞的生长增殖由包括癌基因和抑癌基因在内的一些调控生长发育的基因严密调控，保持正常的生理状态；在受到辐射，损伤，化学污染，病毒感染以及内分泌失衡等多种因素的影响下，导致体内癌基因的激活以及抑癌基因的失活，从而导致的癌症的发生。除了基因突变之外，表观遗传如组蛋白修饰、DNA甲基化等异常调节也在癌基因的激活、抑癌基因的失活以及后续肿瘤的发生发发展过程中起着重要的作用，在多种癌症中均有发现表观修饰的异常。总之，肿瘤的发生时一个极其复杂的过程，是由于体内癌基因、抑癌基因以及表观修饰等异常调节并积累的结果。

DNA甲基化是一种常见的表观遗传(epigenetic)修饰，在DNA甲基转移酶催化下，利用S－腺苷甲硫氨酸提供的甲基，将胞嘧啶的第5位碳原子甲基化，从而使胞嘧啶转化为5－甲基胞嘧啶，其对基因的表达调控有着至关重要的作用。

DNA甲基化与癌症的发生有着密切的关系，在许多癌症中都发现存在DNA甲基化异常的现象。DNA甲基化具有一定的稳定性，它是癌症发生中的复发事件。近年来许多研究证明， DNA的甲基化可以作为一种用药指导的生物标志物。

目前乳腺癌的分子分型的黄金诊断依据是组织免疫切片，由于检测需获取乳腺组织，给病人带来较大的痛苦。同时，乳腺癌的分子分型是临床指导用药的指南，目前，还没有微创或无创的方式检测乳腺癌的分子分型，所以寻找一种方便准确的分子分型标志物对于乳腺癌的用药指导具十分迫切。

发明内容

本发明旨在提供一种特异甲基化位点作为乳腺癌分子分型诊断标志物的应用，以解决现有技术中没有微创或无创的方式检测乳腺癌的分子分型的方法的技术问题。