[发明专利]用于检测人类CYP2C9和VKORC1基因多态性的引物探针组合物、试剂盒及应用有效
申请号: | 201810516170.3 | 申请日: | 2018-05-25 |
公开(公告)号: | CN108570498B | 公开(公告)日: | 2021-11-23 |
发明(设计)人: | 孙秀莲;苏桂锋;李轶群 | 申请(专利权)人: | 山东维真生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 济南泉城专利商标事务所 37218 | 代理人: | 贾波 |
地址: | 250101 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 人类 cyp2c9 vkorc1 基因 多态性 引物 探针 组合 试剂盒 应用 | ||
1.一种用于检测人类CYP2C9和VKORC1基因多态性的组合物,其特征是:包括用于扩增CYP2C9*2位点、CYP2C9*3位点和VKORC1位点的三对特异性引物和三条特异性荧光探针;
所述用于扩增CYP2C9*2位点的特异性引物包括正向引物CYP2C9*2-F和反向引物CYP2C9*2-R,如下:
CYP2C9*2-F:5’GGATGGAAAACAGAGACTTA 3’
CYP2C9*2-R:5’GTCAGTAGAGAAGATAGTAGTCCAGT 3’;
所述用于扩增CYP2C9*3位点的特异性引物包括正向引物CYP2C9*3-F和反向引物CYP2C9*3-R,如下:
CYP2C9*3-F:5’AACGTGTGATTGGCAGAA 3’
CYP2C9*3-R:5’TAGCCCCAAACTGGAAACAAGAG 3’;
所述用于扩增VKORC1位点的特异性引物包括正向引物VKORC1-F和反向引物VKORC1-R,如下:
VKORC1-F:5’CTCAAGTGATCCACCCACCT 3’
VKORC1-R:5’TAGAAGAGAGTAGATGTGAGAAAC 3’;
所述三条特异性荧光探针如下:
(1)用于检测CYP2C9*2位点的特异性荧光探针CYP2C9*2-P:
5’CATTCTTGAACACGGTCCTCAATG 3’ ;
(2)用于检测CYP2C9*3位点的特异性荧光探针CYP2C9*3-P:
5’TCCGAAGGTCAATGTATCTCTGGACC 3’ ;
(3)用于检测VKORC1位点的特异性荧光探针VKORC1-P:
5’AATAAACAACCATTGGCCGGGTG 3’。
2.根据权利要求1所述的组合物,其特征是:所述三条特异性荧光探针均进行了硫代修饰,所述硫代修饰位点均为5’端第1-4个碱基之间的磷酸二酯键。
3.根据权利要求1所述的组合物,其特征是:所述三条特异性荧光探针在5’末端区域均具有荧光基团,在3′末端区域均具有淬灭基团。
4.根据权利要求3所述的组合物,其特征是:所述荧光基团为FAM、HEX或ROX,所述淬灭基团为BHQ1或BHQ2,各特异性荧光探针的荧光基团不同。
5.一种用于检测人类CYP2C9和VKORC1基因多态性的试剂盒,其特征是:包括权利要求1-4中任一项所述的用于检测人类CYP2C9和VKORC1基因多态性的组合物。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征是:还包括PCR混合反应液,所述PCR混合反应液包括:DNA聚合酶、10×HA Buffer、5×Probe qPCR Buffer、dNTPs、dUTP和UDG酶。
7.根据权利要求6所述的试剂盒,其特征是:PCR混合反应液和用于检测人类CYP2C9和VKORC1基因多态性的组合物一起包装,在用于检测人类CYP2C9和VKORC1基因多态性的组合物和PCR混合反应液的混合物中,CYP2C9*2-F、CYP2C9*3-F和VKORC1-F的浓度均为1-1.5μmol/L,CYP2C9*2-R、CYP2C9*3-R和VKORC1-R的浓度均为0.05-0.08μmol/L,特异性荧光探针CYP2C9*2-P、CYP2C9*3-P和VKORC1-P的浓度均为0.08-0.15μmol/L。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征是: CYP2C9*2-F、CYP2C9*3-F和VKORC1-F的浓度均为1.25μmol/L,CYP2C9*2-R、CYP2C9*3-R和VKORC1-R的浓度均为0.0625μmol/L,特异性荧光探针CYP2C9*2-P、CYP2C9*3-P和VKORC1-P的浓度均为0.1μmol/L。
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