[发明专利]MAN1C1基因片段作为猪骨密度性状相关的SNP分子标记

说明书

本发明属于动物分子标记筛选技术领域，具体涉及MAN1C1基因片段作为猪骨密度性状相关的SNP分子标记。该分子标记克隆自登陆号为ASGA0028695MAN1C1基因片段，即猪第6号染色体MAN1C1基因第一内含子上，通过基因芯片技术对该基因进行分型，筛选得到一种与母猪的骨密度性状相关的分子标记，该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，该序列的第401位的碱基处存在一个T/C的等位基因突变，当SEQ ID NO：1序列上的第401位核苷酸为C时，母猪的肢蹄具有更高的骨密度。公开了母猪肢蹄骨密度分子标记的筛选方法及其关联分析。为猪肢蹄结实度性状尤其是骨密度的标记辅助选择提供了新的分子标记资源。

技术领域

本发明属于动物分子标记筛选技术领域，具体涉及MAN1C1基因(登陆号ASGA0028695)片段作为猪骨密度性状相关的SNP分子标记，本发明的分子标记克隆自MAN1C1基因片段，即猪第6号染色体MAN1C1基因的第一内含子上。本发明的标记可用于猪肢蹄骨密度性状的预测。

背景技术

在高产瘦肉型猪的规模化饲养过程中，由于品种选育、营养、遗传、限位栏和漏缝地板的使用等因素的影响，肢蹄问题的发生并非罕见。发生肢蹄问题的猪只可能会出现四肢和蹄部变形，蹄部裂伤、行走困难、瘫痪等现象。猪只一旦发生肢蹄问题，在种猪场中将影响种猪的繁殖性能，降低种猪的使用年限，在商品猪场中，将影响猪的采食进而影响产肉性能。猪的肢蹄损伤，几乎不可逆，在饲养过程中的治疗成本较高，需要耗费大量的精力悉心呵护，治疗周期较长，在生产节奏快的规模化猪场中多会采用淘汰的处理方式。近几年，因肢蹄问题对猪场的造成较大的经济损失，从事猪的生产和育种的工作人员对规模化猪场中的肢蹄问题也日益关注。

蹄结实度是指猪的四肢的结实程度，能够反映猪的四肢的健康程度(候利娟等，2013)。B.和S.Andersen在2000年的研究中，表明猪的肢蹄结实度这一性状具有低到中等遗传力(Jorgensen,B and Andersen,S,2000)，可能存在主效基因。本发明将致力于使用分子标记的方法来提高猪的肢蹄结实度。

除由口蹄疫等传染性疾病引起的肢蹄病，猪的肢蹄病可以分为蹄部变形、蹄裂、蹄部损伤、风湿性关节炎、关节肿大、软组织损伤等(于月龙,2017))。肢蹄病的诊断在养殖生产一线主要靠兽医工作人员利用肉眼去观察，猪的肢蹄发生外部损伤，易观察到，发生损伤的肢蹄可能会出现蹄部皮破、流血等现象，非外部损伤的肢蹄问题会引起猪的行走困难、发生损伤的蹄不敢着地，甚至瘫痪。肢蹄结实度低的猪更易发生肢蹄病，肢蹄病是当今生猪养殖的一个顽疾，规模化养殖的发展，提高了猪生产的效率，但由于环境、育种、营养等因素的改变，导致了肢蹄问题的日益严重，有报道称，种母猪肢蹄病发生率约为30％，因肢蹄病导致的母猪淘汰率为17％～28％(樊新忠,2013)。肢蹄病的产生将影响种猪的使用年限，进而带来经济的损失。