[发明专利]一种用于BRAF基因V600E突变检测的引物对、试剂盒及其检测方法在审
申请号: | 201810547315.6 | 申请日: | 2018-05-31 |
公开(公告)号: | CN108531603A | 公开(公告)日: | 2018-09-14 |
发明(设计)人: | 姚斐;宫小明 | 申请(专利权)人: | 青岛普泽麦迪生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6806;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 青岛清泰联信知识产权代理有限公司 37256 | 代理人: | 张洁 |
地址: | 266071 山东省青岛市市*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 突变检测 引物 突变信号 试剂盒 检测 放大 基因突变检测 假阴性结果 野生型DNA 分子检测 上游引物 生物医学 下游引物 有效减少 突变 应用 | ||
1.一种用于BRAF基因V600E突变检测的引物对,其特征在于,包括如SEQ No.1序列所示的上游引物和如SEQ No.2序列所示的下游引物。
2.一种用于BRAF基因V600E突变检测的试剂盒,其特征在于,包含如权利要求1所示的引物对。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括含有所述引物对的第二试剂盒以及含有与所述引物对配合使用的探针的第一试剂盒,其中,所述探针包括如SEQNo.3序列所示的正义探针和如SEQ No.4序列所示的反义探针。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述第一试剂盒还包括PCR反应管、去离子水、DSN缓冲液和未用DSN处理的阴性对照品。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述第二试剂盒还包括PCR反应管、DSN处理后的DNA样品和未用DSN处理的阴性DNA对照品、Phusion HF缓冲液、去离子水、dNTP和聚合酶。
6.一种利用权利要求2-5任一项所述的试剂盒进行BRAF基因V600E突变检测的方法,其特征在于,包括以下步骤:
将模板DNA、正义探针和反义探针加入第一试剂盒中的PCR管中进行PCR反应,具体包括在98℃下反应2min,待模板DNA变性后,将温度降至67℃,同时加入1个单位的DSN的缓冲液,混匀后在67℃反应20min后,将温度升高至95℃继续反应20min使DSN失活,得到DSN缓冲液处理后的DNA样品;同时,建立不加入1个单位的DSN缓冲液的阴性DNA对照品;
将DSN缓冲液处理后的DNA样品或阴性DNA对照品、引物对、Phusion HF缓冲液、去离子水、dNTP和聚合酶加入第二试剂盒中的PCR管中进行聚合酶链反应,分别得到聚合酶链产物。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,利用所述第一试剂盒进行PCR反应时,各反应物具体加入以下体积,共计10μl:
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,利用所述第二试剂盒进行聚合酶链反应时,各反应物具体加入以下体积,共计25μl:
聚合酶链反应的条件为:98℃反应2min,随后以98℃10sec,58℃20sec和72℃10sec循环45次,最后在72℃反应5min。
9.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,还包括利用PCR纯化试剂盒对所得到的聚合酶链产物分别进行纯化,然后利用桑格序列对其进行分别测序的步骤。
10.一种如权利要求1所述的引物对和权利要求2-5任一项所述的试剂盒在BRAF基因V600E突变检测中对突变信号进行放大中的应用。
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