[发明专利]一种粪便样品常温保存液在审
申请号: | 201810548964.8 | 申请日: | 2018-05-31 |
公开(公告)号: | CN108893523A | 公开(公告)日: | 2018-11-27 |
发明(设计)人: | 肖传兴;姜涛;张帮周;林爱强;秦秋平;林晨怡 | 申请(专利权)人: | 厦门安捷致善医学数据科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 361000 福建省厦门市厦门火炬高新区(*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 保存液 肠道菌群 粪便样品 常温保存液 磷酸缓冲液 硫代氰酸盐 血清白蛋白 络合剂 有机醇 吐温 常温保存 室温条件 样品运输 要求条件 保存 采样 粪便 多样性 外出 | ||
一种粪便样品常温保存液,所述保存液中含有硫代氰酸盐、有机醇、络合剂、磷酸缓冲液、吐温、血清白蛋白,所述保存液中硫代氰酸盐浓度为0.01‑5 M,所述保存液中有机醇占保存液重量的30%‑60%,所述保存液中络合剂浓度为0.001‑0.35 M,所述保存液中磷酸缓冲液占保存液重量的5%‑15%,所述保存液中吐温占保存液重量的0.05%‑1%,所述保存液中血清白蛋白的浓度为2.5‑100 mM。本发明可以对粪便样品中的肠道菌群进行常温保存,确保可以在室温条件下14天内有效保持肠道菌群结构及多样性,降低肠道菌群保存的要求条件及成本,实现在外出采样、样品运输等特殊条件下对粪便中肠道菌群的有效保存。
技术领域
本发明涉及一种生物样品保存液,具体涉及一种粪便样品常温保存液。
背景技术
近年来关于肠道菌群的研究不断涌现,而肠道菌群对人类健康的重要作用也越来越得到人们的关注。肠道菌群是人体肠道的正常微生物群,构成一个复杂的微生态系统,具有种类繁多、数目惊人的特点,研究发现肠道内寄宿的微生物群的种类超过800种。据估算,一个正常成人体内,肠道细菌总重量可达1~1.5kg。肠道菌群在人体消化过程具有重要的作用,可以参与体内的维生素、蛋白质、脂肪等营养物质的合成与代谢,具有促进机体免疫、维护肠道生态平衡、分解营养物质、为宿主提供能量底物的重要作用,并对宿主的生理、病理过程有着重要的影响,具有十分重要的生理功能。但在这数量巨大的菌群中存在着潜在的病原体,在某些诱因下由于菌群种类数量发生变化,而导致机体产生疾病。近些年的研究表明,肠道菌群失调与一些内分泌代谢性疾病、肾脏疾病、神经性疾病、心血管疾病、呼吸系统疾病以及癌症的发生有着密切的关联。
宏基因组测序(Metagenomics Sequencing)是对环境样品、肠道样品中的微生物群落的基因组进行高通量测序,主要研究微生物种群结构、基因功能活性、微生物之间的相互协作关系以及微生物与环境之间的关系。宏基因组测序研究摆脱了微生物分离纯培养的限制,扩展了微生物资源的利用空间,是一种可以为环境微生物群落提供有效研究的工具。
16S rDNA基因是一种能揭示生物物种的特征核酸序列,被认为是最适于细菌系统发育和分类鉴定的指标。16S rDNA分子大小适中,突变率小,是细菌系统分类学研究中最常用、最有用的“分子钟”。其序列包含9或10个可变区(variable region)和11个恒定区(constant region)。保守序列区域反映了生物物种间的亲缘关系,而高变序列区域则能体现物种间的差异。
新一代高通量测序技术自2005年问世以来,以其数字化信号、高数据通量、高测序深度、高准确率等特点,已被广泛的应用于肠道菌群的研究中。随着高通量测序技术的普及,测序成本的不断降低,当前以16S rDNA高通量测序为基本手段,以宏转录组、宏蛋白组、宏代谢组等组学新技术,为微生物组学研究的快速发展起到了极大的推动作用。而16SrDNA测序需要从粪便中提取DNA,然后进行16S rDNA的扩增,因此对粪便进行合适的保存,并保证其在一定时间内群落结构不发生明显变化成了肠道菌群研究的重中之重。
目前医院常规的粪便保存方法为-80℃超低温保存,这种保存方式对于设备有着要求较高,成本高的缺点。且在某些场景下如外出采样、样品运输等无法实现-80℃的超低温保存,特别是在运输途中,长时间的常温保存极易导致群落结构组成发生较大变化,影响后续对肠道菌群的检测,会造成较大的误差。
发明内容
本发明提供了一种粪便样品常温保存液,使粪便样品能够摆脱低温保存的限制,便于在常温中运输和保存,同时减小对后期肠道菌群检测的影响。
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