[发明专利]一种肿瘤资源组织库及其建立方法在审
申请号: | 201810551959.2 | 申请日: | 2018-05-31 |
公开(公告)号: | CN108962396A | 公开(公告)日: | 2018-12-07 |
发明(设计)人: | 潘云;高波;丁跃明;李正金;赵立仙;田林波;路会侠;毕磊;王敏;李耀康;邓刚;陈继樑;杨倩;段月勋;王霖;张春梅;王丽霞;张晓婷 | 申请(专利权)人: | 潘云 |
主分类号: | G16H70/00 | 分类号: | G16H70/00 |
代理公司: | 北京知呱呱知识产权代理有限公司 11577 | 代理人: | 武媛;吕学文 |
地址: | 671000 云南省大理白族自治州大*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肿瘤 资源组织 肿瘤组织 肿瘤高危人群 肿瘤突变基因 分子生物学 表观遗传学 个体化治疗 蛋白组学 基因组学 特征调查 研究材料 遗传咨询 预后评估 早期诊断 肿瘤标本 肿瘤分类 淋巴瘤 恶性肿瘤 遗传学 库房 数据库 筛选 细胞 标本 研究 新鲜 科研 | ||
1.一种肿瘤资源组织库,其特征在于,所述肿瘤资源组织库包括肿瘤资源库房、肿瘤组织标本、肿瘤数据采集系统、肿瘤数据库和云端,所述肿瘤资源库房用于存放肿瘤组织标本,所述肿瘤数据采集系统包括临床信息采集模块、病理信息采集模块、标本信息采集模块、标本使用信息采集模块和标本动态背景信息采集模块,采集到信息存储在肿瘤数据库中,再上传到云端进行汇总。
2.根据权利要求1所述的肿瘤资源组织库,其特征在于,所述临床信息采集模块采集的信息包括:患者姓名、年龄、性别、民族、职业、联系方式、住院号、病理号、临床诊断、病理诊断和检查结果。
3.根据权利要求1所述的肿瘤资源组织库,其特征在于,所述病理信息采集模块采集的信息包括取样部位、肿瘤大小、类型、分级、分期及有无血管浸润和淋巴管转移。
4.根据权利要求1所述的肿瘤资源组织库,其特征在于,所述标本信息采集模块采集的信息包括入库编号、采集时间、入库时间、入库数量、存放位置、收集人、送样单位。
5.根据权利要求1所述的肿瘤资源组织库,其特征在于,所述标本使用信息采集模块采集的信息包括存储日期、借出使用日期、使用人、使用单位、最初的量、当前的量、审批人。
6.根据权利要求1所述的肿瘤资源组织库,其特征在于,所述标本动态背景信息采集模块采集的信息包括所有使用者的审计追踪、研究结果、病例组织的分子遗传学背景。
7.权利要求1-6任意一项所述的肿瘤资源组织库的建立方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
(1)建立肿瘤资源库房,用于保存肿瘤组织标本;
(2)收集肿瘤组织标本;
(3)收集肿瘤患者的血液标本;
(4)通过肿瘤数据采集系统采集以下信息:临床信息、病理信息、标本信息、标本使用信息、标本动态背景信息,然后在肿瘤数据库输入信息资料,再上传到云端进行汇总。
8.根据权利要求7所述肿瘤资源组织库的建立方法,其特征在于,所述肿瘤组织标本的收集从手术取材到快速冷冻所需时间为30~60min;组织冻存块大小为0.5cm3;避免组织污染,每次取材、分装都在无菌条件下进行,带手套操作,使用干净、消毒的器械,保证标本的质量和完整性;避免组织块反复冻融,遵守标本一旦出库不能再入库的原则。
9.根据权利要求7所述肿瘤资源组织库的建立方法,其特征在于,所述肿瘤数据库的建立方法包括以下步骤:
S01获取数据:获取临床信息、病理信息、标本信息、标本使用信息和标本动态背景信息;
S02解析和清洗数据:采用Rete模式匹配算法对获取的数据进行解析,并对解析后的数据进行清洗操作;
S03协议标准化:通过HL7协议的标准规格对解析清洗过后的数据进行统一化处理,得到统一的标准化数据;
S04数据入库:将标准化数据进行分类存储,从而建立不同类型的肿瘤数据库。
10.根据权利要求9所述肿瘤资源组织库的建立方法,其特征在于,所述清洗操作包括步骤:数据预处理;去除或补全缺失的数据;去除内容错误的数据;去除逻辑错误的数据;去掉不需要的数据;进行数据关联性验证。
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