[发明专利]一种检测幽门螺杆菌细胞毒素相关蛋白cagA的LAMP引物组及其应用在审

专利信息
申请号: 201810553375.9 申请日: 2018-06-01
公开(公告)号: CN108531557A 公开(公告)日: 2018-09-14
发明(设计)人: 肖传兴;杨璐溪;李晓燕 申请(专利权)人: 厦门蓝特生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6844 分类号: C12Q1/6844;C12Q1/689;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/01
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 361000 福建省厦门市厦门火炬高新区(*** 国省代码: 福建;35
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摘要:
搜索关键词: 幽门螺杆菌细胞 蛋白cagA 种检测 毒素 内引物FIP/BIP 技术效果 特异性强 整个基因 灵敏度 肠道菌 对引物 环引物 水浴锅 外引物 应用 验证 基因 检测 发现
【说明书】:

发明公开了一种检测幽门螺杆菌细胞毒素相关蛋白cagA的LAMP引物组及其应用,所述LAMP引物组包括内引物FIP/BIP、外引物F3/B3和环引物LF/LB。本发明的技术效果和优点:操作简单:完成反应只需要一台水浴锅,不需要复杂的仪器和专业的操作人员;快速高效:反应仅需30 min;特异性强:针对cagA基因设置3对引物,充分囊括了整个基因序列,三重保障使得针对性极强,通过其他11种常见肠道菌株DNA验证,发现均无假阳问题;灵敏度高:最低检测限为100 fg DNA。

技术领域

本发明属于生物学技术领域,更具体地说,尤其涉及一种检测幽门螺杆菌细胞毒素相关蛋白cagA的LAMP引物组及其应用。

背景技术

长期感染HP会提高胃部疾病的发生率,尤其是慢性胃炎、十二指肠溃疡、胃部恶性肿瘤等,1994年,世界卫生组织/国际癌症研究机构(WHO/IARC)将其列为Ⅰ类致癌因子。但并非所有携带HP的患者都会发病。研究显示,含有细胞毒素相关蛋白A基因(cagA)的HP菌株具有更强的致病性。细胞毒素相关蛋白A(CagA)由cagA基因编码,是HP主要毒力因子。CagA进入胃上皮细胞后,可以与细胞内多种蛋白反应,使胃内细胞功能紊乱,甚至使胃上皮细胞发生病变,从而致病。各项研究指出CagA与十二指肠溃疡、验证和胃癌等肠道疾病关系密切。

此外HP分型检测很困难,因为它可能在宿主体内潜伏很长时间,且不表现出任何症状。目前采用最多的检测方法有:组织病理检查、C13/C14半衰期检查、血清学检测以及PCR反应等,这些方法对仪器要求较高、检测时间长、灵敏度不够且很难做到毒株分型。

针对于此,我们建立了一种灵敏度高、特异性强、操作简单、用时短、成本低,且能准确对HP毒株进行毒性分型的检测方法。该方法基于环介导等温扩增技术(Loop-MediatedIsothermal Amplification,LAMP),在60℃左右水浴10-30 min就可以进行核酸扩增,获得准确的HP分型结果。LAMP整个反应在水浴锅中就可进行,不需要复杂的仪器,且反应中利用多对引物同时进行扩增,特异性强。

发明内容

本发明的目的在于提供一种检测幽门螺杆菌细胞毒素相关蛋白cagA的LAMP引物组及其应用,以解决上述背景技术中提出的问题。

为实现上述目的,本发明提供如下技术方案:一种检测幽门螺杆菌细胞毒素相关蛋白cagA的LAMP引物组,所述LAMP引物组包括内引物FIP/BIP、外引物F3/B3和环引物LF/LB。

一种幽门螺杆菌细胞毒素相关蛋白(cagA)的恒温扩增检测方法,具体包括以下步骤:

S1、所述LAMP引物组包括一对内引物FIP/BIP、一对外引物F3/B3和一对环引物LF/LB组成,引物序列如下:

FIP:TGCAATTTTGTTAATCCGGTCAATTTGAGTGYAAAAATTGACCAAC

BIP:GTTTCAGTGGAGYRGGGCRATGCTTGATTKGYMTCATCA

F3:GCTCAARTTGCYAAAAAGG

B3:CRCTTCTYCTMARAGGGAAG

LF:ATTGCTGATGTAGCTTCGTTGA

LB:KCAGCTAGCCCTGAACCC

三对引物最优比例为8:8:1:1:4:4;

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