[发明专利]一种生物标志物、诊断或预估死亡风险的方法

权利要求书

1.一种用于诊断或预估乳腺癌患者的死亡风险的生物标志物，其特征在于，由以下任意一组特征性基因组组成：SigCYBDEGBC、SigCYBDEGBC1、SigCYBDEGBC2、SigCYBDEGBC3和SigCutpnt；

所述SigCYBDEGBC由以下基因组成：APOD、NOSTRIN、SCUBE2、SLC40A1、SLC7A2、AFF3、CYB5D2、FBP1、STMND1、XBP1、C1ORF106、CALML5、CBX2、CCNE1、KIF1A、KRT16P3、LAD1、SLPI、TTK、UBE2C和S100A8；

所述SigCYBDEGBC1由以下基因组成：FGD3、ITM2A、IDNK、PIGV、CD44、TIPARP、MEF2D、SYTL1、TMEM218、ARL6IP5、APOM、USP35、CEP63、MGARP、PXK、NCCRP1、DDIT4、GLYATL2、DLL3、SLC52A2、PDZK1IP1、STIP1、HIST1H4C、G6PD、TRIB2、CKAP4、GSK3B、TBC1D31、LAGE3、MTBP、GPI、NOLC1、MCU、TMEM138、MFSD2A和ZBTB9；

所述SigCYBDEGBC2由以下基因组成：ITM2A、IDNK、PIGV、CD44、C11ORF1、TIPARP、MEF2D、SYTL1、TMEM218、ARL6IP5、APOM、USP35、CEP63、MGARP、RPGRIP1、PXK、NCCRP1、NFIB、DDIT4、ZSWIM4、FAT1、GLYATL2、DLL3、SLC52A2、PDZK1IP1、STIP1、HIST1H4C、G6PD、RPS6KB2、TRIB2、CKAP4、GSK3B、TBC1D31、SLC19A1、LAGE3、MTBP、GPI、NOLC1、MCU、TMEM138、MFSD2A、ZBTB9；

所述SigCYBDEGBC3由以下基因组成：FGD3、MFAP4、ITM2A、IDNK、PIGV、CD44、C11ORF1、TIPARP、MEF2D、SYTL1、FAM102B、TMEM218、ARL6IP5、APOM、CCDC96、USP35、CEP63、MGARP、RPGRIP1、PXK、ZFYVE28、CALML5、NCCRP1、NFIB、DDIT4、ZSWIM4、FAT1、GLYATL2、DLL3、SLC52A2、IRX6、PDZK1IP1、STIP1、HIST1H4C、G6PD、RPS6KB2、TRIB2、CKAP4、ATAD2、GSK3B、TBC1D31、SLC19A1、LAGE3、MTBP、GPI、NOLC1、MCU、TMEM138、MFSD2A、ZBTB9；

所述SigCutpnt由以下基因组成：FGD3、MFAP4、ITM2A、IDNK、PIGV、CD44、C11orf1、TIPARP、MEF2D、SYTL1、FAM102B、TMEM218、ARL6IP5、APOM、CCDC96、USP35、CEP63、MGARP、PXK、ZFYVE28、CALML5、NCCRP1、DDIT4、GLYATL2、SLC52A2、PDZK1IP1、STIP1、HIST1H4C、G6PD、RPS6KB2、TRIB2、ATAD2、GSK3B、TBC1D31、SLC19A1、GPI、NOLC1。

2.一种用于诊断或预估乳腺癌内在亚型患者的死亡风险的生物标志物，其特征在于，由以下任意一组特征性基因组组成：SigBasal、SigClaudin、SigNorm、SigLumB和SingLumA；

所述SigBasal用于评估基底细胞型乳腺癌患者死亡风险，由以下基因组成：ZNF311和TAX1BP1；

所述SigClaudin用于评估低Claudin蛋白型乳腺癌患者死亡风险，由以下基因组成：ZMYND12、NEBL、NFKBIB和UBL4A；

所述SigNorm用于评估类正常型乳腺癌患者死亡风险，由以下基因组成：HDDC3、EPHX2、MAP2K4、TBCK、MRPS14、SPAG7、UBE2W、ZNF18、CHM、CEP63、TTC30B、GLYATL2和MTA2；

所述SigLumB用于评估腺腔型B乳腺癌患者死亡风险，由以下基因组成：TRIM4、PLPBP、DCTN6、EIF3J、HRK、PDCD2L、MTBP、PPP6R1、TSPAN14、CNOT10和IQGAP3；

所述SingLumA用于评估腺腔型A乳腺癌患者死亡风险，由以下基因组成：TMEM30B、LEF1、NKD2、PIGV、CTDSPL、WDR19、C11ORF1、CRIPAK、MICU2、TACC1、ANKRD12、IMP3、SYTL1、DET1、FUZ、ADPRM、C1ORF123、PCSK6、ECE1、SCN2B、CA9、OASL、ZNF750、VARS、TBC1D22B、ZNF683、XRN1、IL12A、CHPF2、OTOF、TRIM24、CNOT10、ARF1、ACTRT3、CBR1和RAB3GAP2。