[发明专利]一种与光周期敏感的白菜类作物开花时间紧密连锁的InDel分子标记及其应用有效
申请号: | 201810592942.1 | 申请日: | 2018-06-08 |
公开(公告)号: | CN108504769B | 公开(公告)日: | 2021-03-30 |
发明(设计)人: | 肖栋;刘东让;侯喜林;李英;张昌伟;刘同坤;王建军;胡春梅 | 申请(专利权)人: | 南京农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人: | 竞存;徐冬涛 |
地址: | 210043 江苏省南京市栖霞区八卦洲街道江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 光周期 敏感 白菜 作物 开花 时间 紧密 连锁 indel 分子 标记 及其 应用 | ||
1.一种InDel分子标记在鉴定光周期敏感性的白菜类作物开花时间中的应用,其特征在于,所述InDel分子标记的核苷酸序列为ACCCTT,所述InDel分子标记的核苷酸序列位于SEQ ID NO.1所示序列的第727-732位,该ACCCTT序列存在于早花型光周期敏感的白菜类作物的CCA1基因编码区,但不存在于晚花型光周期敏感的白菜类作物CCA1基因编码区。
2.一种检测权利要求1中所述的InDel分子标记的特异性引物对在鉴定光周期敏感性的白菜类作物开花时间中的应用,其特征在于,所述引物对的核苷酸序列如下所示:
正向引物:5′-CCATCATCAGTCCTTTCCTGA-3′(SEQ ID NO.5),
反向引物:5′-AGCTAAAAGGAGCGCAGAGA-3′(SEQ ID NO.6)。
3.权利要求1中所述的InDel分子标记在光周期敏感性的白菜类作物选育中的应用。
4.权利要求2中所述的特异性引物对在光周期敏感性的白菜类作物选育中的应用。
5.根据权利要求1至4任一项所述的应用,其特征在于,包括如下步骤:
(1)提取光周期敏感的白菜类作物待测植株的基因组DNA;
(2)以待测植株的基因组DNA为模板,利用权利要求2中所述特异性引物对,进行PCR扩增反应;
(3)对PCR扩增产物测序,当测序结果显示所测白菜类作物待测植株含有所述纯合InDel标记时,为早开花型;所测白菜类作物待测植株缺失所述纯合InDel标记,且所述缺失纯合InDel标记的基因型不包括杂合情况时,为晚开花型。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,步骤(2)中,PCR扩增体系总体积为40μL:正、反向引物各2μL、模板cDNA 1μL、高保真酶MIX 20μL、ddH2O 15μL;PCR反应程序为98℃预变性2min;98℃变性10s,55℃退火30s,72℃延伸10s,35个循环;72℃延伸5min;PCR扩增产物10℃保存。
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