[发明专利]定量检测S100A16基因表达的引物和探针及其应用

说明书

本发明公开了定量检测S100A16基因表达的引物和探针及其应用。本发明提供了一种成套试剂，包括引物对甲和探针甲；所述引物对甲由引物S100A16‑FP和引物S100A16‑RP组成；所述引物对甲的靶序列含有特异DNA片段甲；所述特异DNA片段甲为如下y1)或y2)：y1)序列表的序列7所示的单链DNA分子；y2)将序列7经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列7具有相同功能的DNA分子；所述探针甲为20‑30个核苷酸组成的单链DNA分子，与所述特异DNA片段甲中的部分区段相同或互补。本发明提供的引物对和探针，可以用于定量检测S100A16基因表达水平。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，尤其涉及一种定量检测S100A16基因表达的引物和探针及其应用。

背景技术

钙结合蛋白S100蛋白超家族是EF螺旋结构超蛋白家族中最大的成员，广泛参与着细胞内外的多种生物学过程，调控细胞的生长、分化、运动、周期、凋亡，并参与了多种疾病的发生、发展。大多数人类S100基因位于1号染色体的长臂2区1带(1q21),而这一染色体区域基因组的不稳定性极易引起染色体的缺失、易位、重叠等改变,与肿瘤的发生密切相关。迄今为止，已发现多个S100蛋白在肿瘤和其它人类疾病中有异常表达。

S100A16钙结合蛋白是近期新发现的S100蛋白家族中的一员，与其它S100家族蛋白相比，S100A16的蛋白结构具有一定的特异性，其羧基端结构和功能仍与其它S100成员的EF端一致，但其氨基端少了谷氨酸残基，丧失了一个Ca2+结合功能，从而只有羧基端可以结合一个Ca2+，该差异可能是S100A16与其它S100家族蛋白功能不同的原因，但具体机制尚不明确。目前为止，S100A16已被发现在多种肿瘤中异常表达，如乳腺癌、膀胱癌、肺癌、甲状腺癌、前列腺癌、卵巢癌等。其中，S100A16表达上调可通过Notch1/ZEB途径促进乳腺癌的上皮间质转化；S100A14和S100A16的共表达与人乳腺癌的不良预后相关，通过与细胞骨架动力学的相互作用促进乳腺癌细胞的侵袭性活动；S100A16还可通过AKT和ERK细胞信号通路促进前列腺癌的细胞迁移和侵袭；此外，高S100A16表达与肺癌、前列腺癌和乳腺癌预后不良相关；近期研究还显示S100A16的低表达与口腔鳞癌(OSCC)和结直肠癌的预后不良相关。

目前尚无S100A16在血液系统恶性疾病的相关研究。

发明内容

本发明的一个目的是提供成套试剂。

本发明提供的成套试剂，包括引物对甲和探针甲；所述引物对甲由引物S100A16-FP和引物S100A16-RP组成；

所述引物对甲的靶序列含有特异DNA片段甲；所述特异DNA片段甲为如下y1)或y2)：

y1)序列表的序列7所示的单链DNA分子；

y2)将序列7经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列7具有相同功能的DNA分子；

所述探针甲为20-30个核苷酸组成的单链DNA分子，与所述特异DNA片段甲中的部分区段相同或互补。

上述成套试剂中，

所述引物S100A16-FP为如下a1)或a2)：

a1)序列表中序列1所示的单链DNA分子；

a2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的单链DNA分子；

所述引物S100A16-RP为如下b1)或b2)：

b1)序列表中序列2所示的单链DNA分子；

b2)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的单链DNA分子；

所述探针甲为如下c1)或c2)：