[发明专利]荧光原位杂交图像的细胞核分割方法及系统

权利要求书

1.一种荧光原位杂交图像的细胞核分割方法，其特征在于：所述方法包括如下步骤：

1)将FISH图像中红、绿、蓝三通道图像的每一个像素点的像素值自减adt_value，实现图像的整体位移；采集三通道图像中的红色通道和绿色通道中大于otsu阈值像素点的位置，将蓝色通道中相应位置的像素点的像素值加权10％或者20％或者30％，弥补细胞核通道中由于红绿点造成的孔洞；将蓝色通道图像中所有像素点的像素值自减h与原蓝色通道图像做灰度重建，得到重建图像img_restruct；

2)对重建图像img_restruct进行二值化处理得到二值图像bw；

3)二值图像bw中呈现出两种孔洞，即核内孔洞和核间孔洞，根据孔洞的几何特性做填充处理，得到孔洞图像img_hole；

4)对孔洞图像img_hole进行形态学操作以平滑图像，得到形态学图像img_morph；

5)对形态学图像img_morph做距离变换处理，将图像上的所有像素点的像素值自减adt_value2与自身做灰度重建再与自身做差得到前景标记临时图像fgm_tmp，去除标记面积过小的区域得到前景标记图像fgm；然后，对前景标记图像fgm做第一次分水岭得到背景标记图像bgm；对去除不属于fgm和bgm的极小值区域的梯度图像做第二次分水岭，得到细胞核分割图像及细胞核的面积、圆形度。

2.根据权利要求1所述的荧光原位杂交图像的细胞核分割方法，其特征在于：所述步骤1)中将蓝色通道中相应位置的像素点的像素值做加权处理的具体方法为将采集的红色通道和绿色通道中大于otsu阈值像素点的位置在蓝色通道图像中找到对应的像素点，将对应像素点的像素值加权10％～30％。

3.根据权利要求1所述的荧光原位杂交图像的细胞核分割方法，其特征在于：在所述步骤1)中所述FISH图像为经过预处理的FISH图像，对FISH图像进行预处理的过程包括对比度处理、曝光度处理、位移处理及灰度校正处理。

4.根据权利要求1所述的荧光原位杂交图像的细胞核分割方法，其特征在于：所述步骤1)中adt_value的取值范围为[20,50]像素，h取值为1.5像素。

5.根据权利要求1所述的荧光原位杂交图像的细胞核分割方法，其特征在于：所述步骤5)中adt_value2取值为2.5，所述面积过小的区域指的是面积小于8像素的区域。

6.根据权利要求3所述的荧光原位杂交图像的细胞核分割方法，其特征在于：所述对比度处理采用的对比度公式为：

所述曝光度处理采用的曝光度公式为：

newValue＝oldValue*(2^{exposureCompensation})

其中，oldValue为每个像素点原始值，newValue为预处理后像素值，contrast为对比度参数，默认设置为1，设置为大于0将FISH图像中对比度增强，设置为小于0将FISH图像中对比度减弱；exposureCompensation为曝光度参数，默认设置为0，取值范围[-5,5]，设置为大于0将FISH图像中高光部分增强，设置为小于0将FISH图像中高光部分减弱。

7.根据权利要求3所述的荧光原位杂交图像的细胞核分割方法，其特征在于：所述灰度校正处理采用的灰度校正公式为

其中，其中，oldValue为每个像素点原始值，newValue为预处理后像素值，灰度校正gamma参数默认设置为1，取值范围为大于0，设置为大于1时将FISH图像中间调变弱，设置为小于1大于0将FISH图像中间调变强。